发简信
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2023-07-11 crossMap不同版本基因组位点坐标转换
CrossMap[https://crossmap.sourceforge.net/#installation] installation do...
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2023-06-14 perl中模式匹配后使用pos()返回匹配位置的问题
总结：如果使用全局修饰符/g，那么下次匹配会从上次匹配的中止位置开始；而不是从0开始；所以在做if筛选条件【if(base2=~/TACG/ )...
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2023-06-09 scRNA-seq分析个人分析记录贴
前言 scRNA-seq越来越成为一种常规测序内容，最近正好分析一些scRNA-seq的数据，把分析过程记录下来，便于后续再次使用。对于走过的坑...
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2023-05-31 windows下Docker的安装
下载DockerDownload Docker Desktop | Docker[https://www.docker.com/products...
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2022-11-14 bigwig文件转换为bed文件在数据分析的时候经常碰到各种文件格式的相互转换，UCSC[http://genome.ucsc.edu/util.html]提供了一些工具。去A...
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2022-10-10 samtools分析测序基因组的depth和coverage
对基因组测序完成后，我们经常需要统计测序深度（depth）和对基因组的覆盖率（coverage） 这两个概念有时候不太好区分，有时coverag...
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2021-10-26 RNA-seq分析个人记录帖
a.整体流程及相关软件 数据资源下载，参考基因组及参考注释组 数据质控及相关软件fastp (代替fastqc，multiqc， trimmom...
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2021-08-23 ChIP-seq数据分析流程（从头到尾）
传送门[https://www.jianshu.com/p/96688fecd864]
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2021-08-09 MAnorm差异分析-一款寻找两个ChIP-Seq样本之间差异peak的软件
3.2 第二种方式MAnorm差异分析-一款寻找两个ChIP-Seq样本之间差异peak的软件 软件网址：https://manorm.read...