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马先生的圆滚滚
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    马先生的圆滚滚

    你好,我想问一下,如果是四条染色体进行比对的话怎么办,只需要按照步骤2-5,进行Ch1和Chr4的共线性分析就行了吗?

    用TBtools,快速高效实现基因组共线性分析与可视化, 赞!

    写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...

    种菜的小王
    70602 27 119
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    马先生的圆滚滚
    强势更新 | 进化尺度上的基因保守区块挖掘

    写在前面 一年前,我看到课题组其他成员在整一个“进化保守区块”挖掘的工作。说实话,觉得....挺麻烦。于是我写了一个工具,具体见推文《进化保守的基因区块-可视化挖掘》。 这个...

    生信石头
    2527 1 19
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    马先生的圆滚滚
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    半夜一更

    写了 33532 字,被 270 人关注,获得了 144 个喜欢

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    马先生的圆滚滚
    直到现在,我仍常常有放弃 TBtools 的想法

    我有无数次想放弃继续开发 TBtools 的想法,原因种种。有时候会想得很清楚,这本来就是一个不务正业的副产品;有时候会觉得很痛苦,尤其是一些人就是不愿意在社群讨论,一定要找...

    生信石头
    1449 4 22
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    马先生的圆滚滚

    看我们这样的菜鸟把大佬都逼成啥样了,惭愧惭愧啊

    直到现在,我仍常常有放弃 TBtools 的想法

    我有无数次想放弃继续开发 TBtools 的想法,原因种种。有时候会想得很清楚,这本来就是一个不务正业的副产品;有时候会觉得很痛苦,尤其是一些人就是不愿意在社群讨论,一定要找...

    生信石头
    1449 4 22
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    马先生的圆滚滚
    Avatar notebook default
    TBtools常见使用问题

    生信石头 编,16 篇文章,224 人关注

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    马先生的圆滚滚
    重磅更新!Rserver 插件 for TBtools

    写在前面 知道我的朋友,相信都有了解,元旦假期某晚凌晨,我突发起来,折腾了一个困扰我很久很久的问题,并解决了他。2015年,TBtools 开发之前,我写过一个 Blast3...

    生信石头
    4256 5 7
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    马先生的圆滚滚

    按这个步骤做出来的图是空的啊?

    如何高效而且优雅地比较多物种的不同基因组区域?

    写在前面 高通量测序技术的普及,带来的是遍地的基因组。昨日,OneKP项目又发了一个Paper【因为很久以前他们就发过,数据也早就可以获取】。他们再发多少paper,事实上,...

    生信石头
    16802 1 51
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    马先生的圆滚滚
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    生物女学霸

    写了 34580 字,被 275 人关注,获得了 149 个喜欢

    一起来聊聊生命科学的那些事儿。
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    马先生的圆滚滚
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    sober01

    写了 9641 字,被 179 人关注,获得了 181 个喜欢

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    马先生的圆滚滚
    180
    组学大讲堂

    写了 107229 字,被 3089 人关注,获得了 2296 个喜欢

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    马先生的圆滚滚
    菠萝WRKY基因家族分析文章

    做科研的都知道开创性的工作自然意义重大,但那是可遇不可求。迅速跟进大牛们开创性的思路或者方法,结合自身的研究基础,做出类似的成果无疑是个高效的策略。 早些年的转录组可谓是典型...

    组学大讲堂
    8430 0 59
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    马先生的圆滚滚
    2020年-基因家族分析文章怎么发!

    最近,小编看到这样一种说法“基因家族分析类文章已经过时了,很难再发SCI了”。这是真的么?答案当然是否定的!闲暇之余,小编搜索统计了2020年截至到今天的基因家族分析文章的数...

    组学大讲堂
    4408 0 28
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    马先生的圆滚滚
    绘制 SNP 密度图

    一般使用 CMplot 绘制SNP密度图:包链接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图,仅仅需要三列即可:a. 第...

    正踪大米饭儿
    29786 26 140
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    马先生的圆滚滚
    180
    正踪大米饭儿

    写了 45217 字,被 890 人关注,获得了 875 个喜欢

    小刘哥,农民、生信民工、程序员、理想主义者
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    马先生的圆滚滚
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    负反馈电池

    写了 0 字,被 511 人关注,获得了 807 个喜欢

    微信yangtze0056<br>空气动力学博士<br>关注同名微信公众号“负反馈电池”,有所有被简书封禁的文章<br>转载文章请与本人联系。我已加入“维权骑士”(rightknights.com)的版权保护计划。
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    马先生的圆滚滚
    基因功能注释

    根据已有的蛋白库,对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对,从而获得相应的信息。 常用的数据库: Nr:NCBI官方非冗余蛋白数据库,包括PDB, Swiss-Prot, PIR...

    斩毛毛
    21528 10 41
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    马先生的圆滚滚
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    南博屹生物医学

    写了 146812 字,被 829 人关注,获得了 875 个喜欢

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    马先生的圆滚滚
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    TOP生物信息

    写了 167032 字,被 3966 人关注,获得了 2357 个喜欢

    公众号:TOP生物信息<br>B站:TOP菌<br>WeChat:TOPJUN996<br><br>top2读研,学习方向:癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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