以科学家的心态打游戏，以玩家的心态做科研。
IP属地：湖南
-
老师，我安装r8s报错这个make: *** No rule to make target 'continuousML.h', needed by 'continuousML.o'. Stop.但是src里面根本没有这个文件。
基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上）
一、数据准备 首先，选取不同物种的Protein数据集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Dimocarpus_longan...
-
我也是这个问题，请问解决了吗？
2023-03-02 r8s 在centos07的安装
1、软件下载 进入这个网址 https://sourceforge.net/projects/r8s/ 2、下载之后解压 tar -xzvfr8s1.81.tar.gz 3、...
-
请问一下用EVM整合，augustus.gff应该如何修改格式呢？
使用MAKER进行基因注释(高级篇之GeneMark-ET模型训练）
GeneMarkGeorgia Institute of Technology开发的一系列基因预测工具。真核生物基因组预测主要会用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
-
这个augustus的gff是能直接用的吗？不用修改格式吗？
基因结构注释（1）：从头注释
前言 最近的推文将是一个大系列，目录就不放了，可能会有点多，主要涉及了基因注释，比较基因组学分析，基因家族分析等，大家看我博客的顺序就行。 基因注释参考链接[https://...
-
请问有用到maker吗，我一旦选择augustus物种，maker就会失败。
2023-05-23 augustus训练
正在更新。英文是真的看不习惯。参考：使用MAKER进行基因注释(高级篇之AUGUSTUS模型训练） - 简书 (jianshu.com)[https://www.jiansh...
-
为什么我加上augustus参数，就失败了？
基因注释：基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
我使用的maker版本为3.01.04 第一轮：将已知基因比对到基因组 包括两个部分：🔸屏蔽重复序列🔸将已知的转录组/蛋白序列与基因组进行比对 1.（可选）构建自定义重复序列...
-
我在使用maker时遇到了这样的错误，请问博主知道如何解决吗？ERROR: RepeatMasker failed
--> rank=7, hostname=localhost.localdomain
ERROR: Failed while doing repeat masking
ERROR: Chunk failed at level:0, tier_type:1
FAILED CONTIG:HiC_scaffold_2使用MAKER进行注释: 学习MAKER的配置参数
MAKER配置文件详解 本文翻译自http://weatherby.genetics.utah.edu/MAKER/wiki/index.php/The_MAKER_cont...
-
请问输入Maker的文件是什么？
使用MAKER进行基因注释(高级篇之AUGUSTUS模型训练）
准备训练集和测试集 根据Augutus的官方教程，可靠的基因结构序列的要求如下： 提供基因的编码部分，包含上游几KB。通常而言，基因越多，效果越好，至少准备200个基因以上。...
-
请问楼主线粒体是用什么软件组装的呀？
对组装完成的线粒体基因组进行纠错
1.三代数据纠错minimap2+racon(迭代三次) 2.二代数据纠错bwa+pilon(一次) 报错：pilon内存不足 或者 调大软件设置的内存限制 3. 检查、验证...
-
这个能组装植物的吗？
线粒体组装软件MitoZ安装及运行
线粒体组装软件MitoZ安装报错：sqlite3.IntegrityError: UNIQUE constraint failed: synonym.spname, syno...
-
