Introduction 此课程是Coursera上，John Hopkins University 的 Genomic Data Science的Course4，Cours...
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Genomic Data Science- JHU Course 4 Algorithm for DNA Sequencing 笔记 -
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manta 鉴定SV
Manta Structural Variant Caller 详情：https://github.com/Illumina/manta[https://github.com...
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RNAseq-踩坑02 -- Aligment 比对率低RNAseq的第二步就是Aligment, 一般都是有参考基因组的比对，据同事介绍，比对这一步，比对率再80%以上才算是正常的，很多样本的比对结果都能达到90%以上。 然而，...
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跟着Nature Genetics学二代测序数据分析：使用NOVOPlasty组装生菜的叶绿体基因组论文是Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestication histor...
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【linux】单行命令-第2部分：Bioinformatics one-liners
单行命令，化繁为简，重剑无锋，大巧不工。接下来学习生信实用单行命令。 基础awk和sed命令 sed: stream editor流编辑器 提取文件的2，4，5列： 输出文件...
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plink参考
PLINK语法体验 by张成龙 邮箱：yianquanwl@qq.com[mailto:yianquanwl@qq.com] 该教程参考邓飞博客与自己总结 plink软件是G...
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RNA-seq 可变剪切可变剪切定义 有些基因的一个mRNA前体通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点）产生不同的mRNA剪接异构体，这一过程称为可变剪接(或选择性剪接， alternative s...
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共同修炼生物信息分析技能，研究前沿创新技术，升级打怪！
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本人目前从事生信分析相关领域， 记录一些常见的坑，也希望能帮助到类似经历的人。
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RNAseq常规流程转录组分析是生信分析的一个基础和常见的分析流程，一般从下机数据开始，经过一系列的质控，基因组比对，差异分析等过程得到实验组与对照组（或者肿瘤中的转移组和原癌组）中差异表达的基...
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基础医学，学习生信分析中
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RNAseq上游流程1. 软件安装 1.1需要更改镜像源配置 1.2 安装软件 创建环境 转录组分析需要用到的软件列表 质控fastqc , multiqc, trimmomatic, cuta...
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转录组解释转载三四十页的转录组的测序报告不知该如何入手，众多分析结果不知该关注哪些？今天我们就从RPKM到KEGG，慢慢给你讲解。 01 什么是RPKM值？ 02 如何看懂火山图？ 03 ...
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一些有趣且鲜为人知的 Python 特性这是Github上的一个项目，英文原版已经收获超8000的星标。 https://github.com/leisurelicht/wtfpython-cn What the ...
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记录自己学习python的点点滴滴轨迹，希望以后回来看这个专题的时候，自己能有了更大的进步ヾ(●´∇｀●)ﾉ哇～
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Pythoner的集中营, 收集关于Python的各种知识教程. 推荐文章和系列阅读: 1. Python 零基础入门资料整理（更新版） http://www.jianshu.com/p/9c02dade7e90 2. Python 零基础入门资料整理 http://www.jianshu.com/p/5eee782b8627 3. Python 从入门到高手系列视频教程 http://www.jianshu.com/p/93085280e4a4 4. Python学习网络资源整理 http://www.jianshu.com/p/fe0e5a515696 5. Python爬虫学习系列专题 http://www.jianshu.com/notebooks/255245/latest 6. Python Django博客开发专题 http://www.jianshu.com/notebooks/293635/latest PS: 另招Python热心管理员
