此篇简书是线性相关分析（秩相关），可视化是热图； 还有其他相关分析方法（如基于峰值模型和降维手段的CCA分析）及对应的图，应该适合不同生物类群install.packages...
IP属地：贵州
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用R语言进行物种丰度和环境因子的相关性分析 -
有偿就算了hh，谢谢，我自己画出来了
宏基因组测序分析（三）物种组成及丰度估计
基于测序数据，使用 kraken2 进行 reads 的物种注释，使用 braken进行丰度估计，之后基于丰度进行物种多样性分析及差异物种分析。 数据库构建 运行 krake...
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请问如何把OTU表中taxonomy列中的属单独分离出来（ k__Bacteria; p__Pseudomonadota; c__Alphaproteobacteria; o__Hyphomicrobiales; f__Nitrobacteraceae; g__Bradyrhizobium; s__sp. 200）并且合并成如您所示的示例表格呢？
群落堆叠柱状图+冲击图绘制
群落堆叠柱状图示例文件1.某一分类级别丰度文件： 2.分组文件： OK，接下来开始绘制： 1.准备一下颜色信息 因为属或种水平物种比较多，可以多准备一些 准备作图文件 普通柱...
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群落堆叠柱状图+冲击图绘制群落堆叠柱状图示例文件1.某一分类级别丰度文件： 2.分组文件： OK，接下来开始绘制： 1.准备一下颜色信息 因为属或种水平物种比较多，可以多准备一些 准备作图文件 普通柱...
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请问大佬，这里绘图的R脚本可以提供吗？
宏基因组测序分析（三）物种组成及丰度估计
基于测序数据，使用 kraken2 进行 reads 的物种注释，使用 braken进行丰度估计，之后基于丰度进行物种多样性分析及差异物种分析。 数据库构建 运行 krake...
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宏基因组测序分析（三）物种组成及丰度估计基于测序数据，使用 kraken2 进行 reads 的物种注释，使用 braken进行丰度估计，之后基于丰度进行物种多样性分析及差异物种分析。 数据库构建 运行 krake...
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RNA-Seq：差异表达分析及可视化上一篇已经系统介绍了有参RNASeq上游分析，从测序数据fastq文件到最终生成表达矩阵。这一系列基本都是RNASeq通用常规分析，其下游差异表达及可视化则根据需求及...
