此篇简书是线性相关分析(秩相关),可视化是热图; 还有其他相关分析方法(如基于峰值模型和降维手段的CCA分析)及对应的图,应该适合不同生物类群install.packages...
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此篇简书是线性相关分析(秩相关),可视化是热图; 还有其他相关分析方法(如基于峰值模型和降维手段的CCA分析)及对应的图,应该适合不同生物类群install.packages...
群落堆叠柱状图示例文件1.某一分类级别丰度文件: 2.分组文件: OK,接下来开始绘制: 1.准备一下颜色信息 因为属或种水平物种比较多,可以多准备一些 准备作图文件 普通柱...
基于测序数据,使用 kraken2 进行 reads 的物种注释,使用 braken进行丰度估计,之后基于丰度进行物种多样性分析及差异物种分析。 数据库构建 运行 krake...
上一篇已经系统介绍了有参RNASeq上游分析,从测序数据fastq文件到最终生成表达矩阵。这一系列基本都是RNASeq通用常规分析,其下游差异表达及可视化则根据需求及...