多种批次效应去除的方法比较 原创 生信技能树 前面我在生信技能树推文:你确定你的差异基因找对了吗? 提出了文章的转录组数据的60个样品并没有按照毒品上瘾与否这个表型来区分,而...
今天去拉git代码发现一个问题remote: Support for password authentication was removed on August 13, 20...
杀杀生信分析中,我们在全基因组测序后会获得分子突变谱信息,如何直观地将各种疾病分子亚型下的基因突变特征,以及分子共突变/互斥突变的特征展示出来呢? 我们可以使用R语言中一个非...
什么是瀑布图 这种由麦肯锡顾问公司所独创的图表类型,因为形似瀑布流水而被称之为瀑布图( Waterfall Plot)。瀑布图具有自上而下的流畅效果,也可以称为阶梯图(Cas...
简介[#toc_0] Mamba是在c++中对conda的重新实现,可以认为是更高级的conda。有以下特点使用多线程并行下载数据和package,实现更高效的安装libso...
这是我听孟浩巍知乎LiveB站鲮鱼不会飞视频(转录组分析进阶课程)里的笔记哦~ 本次知乎Live解决的问题: 转录组的建库与质量控制 人类基因组与转录组组成 转录组的2种建库...
survminer的基础用法指南 本文全部代码及示例数据领取:公众号后台回复surv领取。 生存分析是将事件的结果和出现这一结果所经历的时间结合起来分析的一类统计分析方法。不...
(免费教程+代码)|跟着Cell学作图系列合集 “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习生信的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell.2020.05.032[...
在肿瘤研究中往往需要分析一些事件(如死亡、复发)的时间是否与一些因素相关,像这样数据输出为事件和时间的分析称为生存分析。因为删失数据的存在,让生存分析不能用许多常规的数据分布...
肿瘤研究中,生存分析是逃不掉的一关,如果用R语言进行分析,survminer包是必备的法宝,下面就共同学习下survminer包的Cheat Sheet吧。 变量含义: ti...
Title: Development and validation of a prognostic nomogram for HIV/AIDSpatients who und...
今天读到了一句话:“高明之家,鬼瞰其室”,其意思是那些富贵显达的人家,会遭到鬼的窥视,总有一天会遭殃的。 其实哪里有鬼在窥视,是人不知道谦卑,总觉得自己聪明绝顶、手眼通天,损...
生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断,研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法,也称生...
不知从TCGA下了多少次数据了,每次都像失忆了一样重新研究……果然凡事都该动笔记下来 TAT本次以肝癌数据为例操作系统:MAC OS 1. 登陆TCGA网站 https://...