总说：把坐标点从excel里面导入到gis里，保证两个图层坐标系一致，然后把你新导入的点文件，转出来，转成新的shp，然后多值提取到点即可。 1、材料：一张全球干旱指数分布t...
发简信
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Arcgis根据经纬度批量提取属性值 -
samtools sort & index
整理高通量测序中使用的软件。 比对软件产生的序列通常是随机的。然而，比对后的分析步骤通常要求sam/bam文件被进一步处理，例如在IGV查看比对结果时，常需要输入的bam文件...
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群体变异数据vcf文件过滤概念及使用方法
标记过滤指标概念 miss 缺失率，即标记缺失的比例 一般过滤0.1或者0.2；对于简化基因组的也有进行0.5的过滤的，看具体需求了 maf 最小等位基因频率 一般过滤0.0...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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一文读懂FastQC Report前言：从今天开始就开始为拼装转录组做准备啦，今天听了技能树组织的生信人论坛，感觉很有意思。特此声明：本文所有代码及文件经通过本人亲自实践！绝对没有副作用！当然希望大家多提出宝...
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转录组分析实战第一节：Rawdata的质量控制与清理在转录组数据拿到后，公司一般会给我们一个Rawdata和Cleandata 如果喜欢折腾的可以直接拿着Rawdata进行一下数据清理后再进行后期的数据分析 我们今天就对我们之...
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关于SNP的过滤（1）：如何使用vcftools进行SNP过滤
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...
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「博客翻译」SNP过滤教程（一）原文地址: SNP Filtering Tutorial 感觉文章写的真棒，于是就翻译了一遍 目标 学习如何使用VCFtools根据缺失信息，基因型深度(genotype d...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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「简化基因组」如何过滤用GATK分析得到的SNPGATK官方提供了一个SNP过滤的标准，howto-apply-hard-filters-to-a-call-set,如果你按照它的要求来过滤简化基因组中的SNP数据，也就是...
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SNP过滤时常用参数的解析（群体遗传）关于为何要进行SNP的过滤： 第一，低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果，甚至影响后续对生物学问题的解释；第二，群体研究时，由于测序的个体较多检测出来...
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每天读一遍，二十天后你的情商会突飞猛进！
每天读一遍，二十天后你的情商会突飞猛进！ 1.清醒时做事，糊涂时读书，大怒时睡觉，独处时思考。 2.话别说太满，人别熟太快。 3.人前不应该说的话，背后也别说。 4.在最愤怒...
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别装了！女人也是下半身动物
我在上大学时，听到一个女生笑着说：“男人是下半身动物，女人是上半身动物”。我自惭形秽之下，又若有所思：“男人果真如此不堪？女人果真如此高尚？” 经历了一些男女情事，也看惯了一...
