根据浙科版高中生物学选修一38页淀粉水解流程图的描述，很容易让人误以为三者的作用底物分别为淀粉、糊精和麦芽糖，为了便于理解几类淀粉酶的作用，先需要辨析两组概念：直链淀粉与支链...
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α-淀粉酶、β-淀粉酶和糖化淀粉酶的区别
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草食性和肉食性动物的消化系统差异
今天我来分析一下草食性和肉食性动物的消化系统差异 第一是牙 肉食动物一般都有特别长的牙齿，这是为什么呢？我猜测可能是因为，它的食物来源导致它的牙齿...
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广义线性模型一（Generalized Linear Models，GLM）参考从线性模型到广义线性模型（1）——模型假设篇 | 统计之都 (cosx.org)[https://cosx.org/2011/01/how-does-glm-genera...
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广义线性混合模型（GLMM）
知识背景 广义线性混合模型可以看做是广义线性模型（GLM）以及线性混合模型(LMM)的扩展，为了更好地理解GLMM，肯定要对普通线性模型、广义线性模型以及线性混合模型有个理解...
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R语言的排序函数(order, sort, rank)及匹配函数（match,%in%)用法详解
一，排序函数 R语言中，和排序相关的常用函数有：order()，sort()，rank()，一般是对向量进行操作，也可以对数据框的列进行操作。1. order(..., de...
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R 函数笔记 | grep()函数与R语言中的正则表达式
grep()能对向量中特定条件的元素进行查询，默认return为index。grep()语法与grep()大致相似，但默认return为logical。 grep() 代码如...
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R数据分析：嵌套数据分析为什么要用加随机效应？终于解释清楚了
自己已经写了好几篇关于随机效应模型的文章了，今天换个角度，从传统回归和随机效应模型的对比中模拟出两模型真正的差异，让你明白加上随机效应到底对模型会有什么样的改变。 回顾 在传...
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R数据分析：混合效应模型的可视化解释，再不懂就真没办法
好多同学咨询我混合效应模型，有些问题自己需要讲很多遍，想想就再开一贴，争取这一篇文章给大家写清楚。 混合效应模型名字很多，Hierarchical Modeling, als...
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R | 简单的学生检验（t-test）
Student's test —— 简称t-test，据说是作者当年为避风头而用‘’学生”这一笔名，所以就将该种方法称为学生检验了。百度百科：t-test 主要用于样本含量较...
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R语言中的管道%>%
本文首发于我的个人博客[https://www.ikeguang.com/?p=1783] ％>％来自dplyr包的管道函数，我们可以将其理解为车间里的流水线，经过前一步加工...
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PLS-DA代替PCA试试降维效果？最近有小伙伴问道PLS-DA（Partial least squares Discriminant Analysis，偏最小二乘判别分析），一种组学分析中常用的多变量分析方法...
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R语言可视化（十六）：PCA图绘制16. PCA图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 加载示例数据 使用prcomp函数进行PCA分析 使用基础plot函数绘制PCA图 使用ggplot2包绘制PCA图...
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用PLS和OPLS分析代谢组数据简介例1. 不同品种代谢产物OPLS-DA loading plot1 安装2 内置数据介绍 代谢物对个体性别的定性响应 - PLS执行PLS-DA结果参数解释模型评估常用可...
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方差分析（ANOVA)原理及其实现
诸如t-test, one-way anova, two-way anova等统计学差异显著性分析在生物实验中非常常见。这些分析手段的计算公式对于搞生物的人来说还是比较复杂的...
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差异分析工具STAMP手册2:使用手册（汉版）出于时代的自觉，我主动承担了STAMP(Statistical Analysis of Metagenomic Profiles)使用文档的翻译工作。原文28页，翻译如下，欢...
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宏基因组功能注释（以COG为例）Contigs/Scaffolds序列经基因预测、ORF开放阅读框识别（Open Reading fr ame）和蛋白翻译之后，就可以进行功能注释分析了。我们将基因/蛋白序列...
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宏基因组 - (4)使用dbCAN2对非冗余基因集进行CaZy注释(待更新-1.仅作笔记使用 我所用到的所有脚本可以+Q 840842906索 简单介绍一下方向也可以，说不定以后能互相帮忙～ 0. 功能注释这一块大体上就是用自己的序列去和各种数据库...
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KEGG pathway 注释整理
KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库)，可以获得KEGG ORTHOLOGY(KO...
