前言 只有光头才能变强 这个学期开了Linux的课程了,授课的老师也是比较负责任的一位。总的来说也算是比较系统地学习了一下Linux了~~~ 本文章主要是总结Linux的基础...
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数据可视化分析中我们经常需要进行数据间的统计分析,并进行显著性标记,虽然ggpur包被大佬吐槽制造混乱,但在进行显著性标记标记方面也是有其可取之处。 下面主要展示ggpubr...
根据rawdata算出来FPKM,然后进行单个基因与其他基因之间相关性的计算 转置后文件内容为:纵坐标是样本名称,横坐标是不同基因的Ensembl 这样就算好了基因间的相关性...
这篇文章是WGCNA系列的最后一篇,其余见链接:WGCNA(1):R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com...
WGCNA得到模块之后如何筛选模块里面的hub基因 原创 生信技能树 我在生信技能树多次写教程分享WGCNA的实战细节,见: 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版)[ht...
最近有很多人在给他们做完了WGCNA分析之后,跑过来问结果中各种图片的意思。我就整理一下WGCNA分析结果中常见图片的含义吧,如有理解错误,还请各位大神批评指正! 首先,当然...
GSEA背景 比如你读到一篇文献,里面的作者设计了一系列实验,其中一个实验是,knock down基因X,对WT和KD进行RNA-seq实验,比较WT和KD的表达谱的变化,从...
铁(iron)是人体必需的微量元素,存在于所有细胞中。除红细胞生成外,铁还参与各种生理和病理过程,例如氧气运输和储存、线粒体功能和免疫系统(Crielaard等,2017)。...
关于数据操作的另一个流行的包是dplyr,它发明了一种数据操作语法。dplyr扩展包并没有使用构建子集函数([ ]),而是定义了一系列基础的变形函数作为数据操作模块,并且引入...
铁死亡(Ferroptosis)最早由哥伦比亚大学Dr. Brent R.Stockwell在2012年提出,是一种铁依赖性的,区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自噬的新型的细胞...
为了解决四个难题我们设计开发了“GSEA简易分析工具”和” GSEA结果可视化工具” 01—研究背景 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分...