发简信
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基因家族分析（1）——基因家族成员的确定②
更多内容关注微信公众号：“今日之森” 后获取。 直奔主题 基因家族分析（1）——基因家族成员的确定①简单介绍了一下分析策略和数据下载。 今天就随便找一篇文章，通过实践操作来快...
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结构变异SV的鉴定--smartie-sv与bayestyper
最近一直在折腾结构变异SV的鉴定，SV的鉴定软件虽然很多，但是在最近的两篇基因组文章里面，主要用的是smartie-sv和bayesTyper，其中smartie-sv主要用...
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动植物重测序--遗传图谱遗传图谱简介 遗传图谱(Genetic linkage map )：又叫连锁图谱（Linkage map）、遗传连锁图谱、染色体图。是指基因或 DNA 分子标记在染色体上的相...
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重测序数据（简化基因组和非简化基因组）的Clean data 到snp-indel的vcf步骤
最近有多个朋友问我关于二代重测序数据的分析问题（clean data 到vcf），我写了一个完整的步骤如下，若你是多个样品进行分析，最好是写 循环语句，这里我仅举一个例子“s...
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关注：生物统计，数量遗传，混合线性模型，生物信息，R，Perl，Python，GWAS，GS相关方法，文章及代码<br>
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QTL上位性分析：QTLNetwork2.0官网：http://ibi.zju.edu.cn/index.html/BCL/software/qtlnetwork/download.html[http://ibi.zj...
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「Primer Check」支持「多态性」引物筛选了~~写在前面 至此，「TBtools」中「分子辅助育种」相关的功能释放 30% 了。第一阶段结束。余下功能，预计等暑期慢慢释放。「功能开发」的难度。作为阶段结束推文，相对简单，是...
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关于单倍型和Phasing
单倍型，即单倍体基因型，概念很好理解。 单倍型分型的过程就称之Phasing，定相或基因分型。 Phasing的意义，在人类疾病遗传和动植物群体遗传中非常重要。也是imput...
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单体型图谱简介（3）群体结构分析 在一个大群体中，不同的个体之间群体结构是存在差异的，换句话说就是不同个体的遗传物质来自不同的祖先。 系统发生树分析 通过Mega或phylip等进化树分析软件，...
