在使用Bioconductor 分析芯片数据（一）中我们使用的是芯片的原始数据（即*.cel文件）进行分析，但在大部分情况下我们是可以利用GEO数据库中已有的表达矩阵来进行数...
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GEO数据挖掘小尝试：（一）寻找共同差异基因 -
# 花5分钟给你的Paper加几张Figure， TCGA蛋白数据这样挖！！TCGA蛋白数据挖掘神器来了 作者：白介素2 TCGA的神器这么多，据白介素同学所知，能够做 TCGA蛋白数据挖掘目前寥寥无几，好用的暂时木有发现，原因是啥，也不清楚。最近出...
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R语言for循环01-批量完成相关系数计算
在数据分析过程中，尤其是在做基因筛选时，常会应用到批量筛选，这也是应用R语言分析数据的优势之一。在这一点上往往在线工具不能提供这样的功能。 我们来构建一个虚拟数据，来完成基因...
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ggpubr包系列学习教程(一)ggpubr: 'ggplot2' Based Publication Ready Plots 一款基于ggplot2的可视化包ggpubr，能够一行命令绘制出符合出版物要求...
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GEPIA：点点鼠标分析TCGA数据-超高自由度随着公共数据库的建立和开放，越来越多的研究者可以接触到测序数据，非常适合想我们这种“三无”研究者（无课题，无经费，无文章）运用公共数据找点事情干，可以是另辟蹊径从某个独特的视...
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喜欢写代码的外科医生。
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公众号: 医科研<br>wechat: YKY7060
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Circos手把手极简入门（Windows篇）Circos是数据展示的一个极佳方式。是每一个男人都应该学会的必备技能！ 如果按照我这个教程都搞不定的话，还是建议先别看别人的高阶教程了。 Circos安装及测试 首先，下载...
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到了简单进阶到最后，按照图片的代码敲（发现有些地方有误），总是出现如下错误：
error processing tick - this tick's spacing_type is set to absolute, but no spacing or position parameter is set at D:/circos-0.69-6/bin/../lib/Circos.pm line 5459.
Circos::process_tick_structure(HASH(0x5fb9790), HASH(0x62c2620)) called at D:/circos-0.69-6/bin/../lib/Circos.pm line 4719
Circos::draw_ticks("ideogram", HASH(0x62c2620)) called at D:/circos-0.69-6/bin/../lib/Circos.pm line 1087
Circos::run("Circos", "outputdir", ".\\result", "configfile", ".\\circos.conf", "_argv", "-conf .\\circos.conf -outputdir .\\result -outputfile myfile1", "_cwd", ...) called at ..\bin\circos line 536 -
如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析如何分析芯片数据 我最早接触的高通量数据就是RNA-seq，后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据，因此我从来没有分析过一次芯片数据，而最近有一个学员在看生信技能树在...
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生信人的R使用生信技能树联盟入门视频：生信技能树视频课程学习路径，这么好的视频还免费！ 专题历史目录：3个学生的linux视频学习笔记 接下来介绍R语言： 【生信技能树】生信人应该这样学R...
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搬砖的工人<br>
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生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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GEO数据挖掘小尝试：（二）蛋白质互作网络分析在上一篇文章《GEO数据挖掘：（一）寻找共同差异基因》中我们通过两个实验的数据寻找到了一些差异基因，本篇文章将对这些差异基因的互作关系进行简单的分析，用到的工具主要有Stri...
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