各种生存分析-傻傻分不清 作者：白介素2 OS 总体生存期： Overall Survival 定义： 结局指标是死亡时间，这个死亡是任何原因导致的死亡都算进去，只关心是否死...
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OS/PFS/DFS/DSS各种生存指标傻傻分不清
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ggplot2 中的 position_dodge命令
ggplot2 软件包中 position_dodge 命令的说明文档如下：width: Dodging width, when different to the width...
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R语言基础入门(4) mutate函数创建新列
今天继续介绍dplyr包中的重要函数mutate，其基本功能为创建新列；mutate中的选项几乎是无穷无尽的，可以通过各种函数之间的组合来对数据集做任意的处理，下面通过具体的...
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根据bam文件推测捕获区间（bed）/获取全部基因（exon）的区间1，将UCSC的refFlat.txt转换成bed文件 基因全长bed refFlat.txt文件示例： hg19.genes.bed文件示例： 注：老版本的cnvkit自带...
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彼得潘之岛：天堂还是地狱？今天跟大家分享的《喂，出来》中的故事是：彼得潘之岛。不知道上世纪六七十年代的岛国是否也出现了对“应试教育”的反省，所以作者才会写下这则故事？ 教育的目的绝不因该是让每个人都成...
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org.Hs.eg.db 包的使用jimmy布置的个R语言中级作业中提到了几个R包，我查找了Bioconductor中org.Hs.eg.db包的使用说明书，为了自己更好的理解和应用，做了以下笔记。 首先了解...
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COSMIC数据库介绍——癌症研究者必看这是Sanger 研究所 2018 年 发表的在《Nucleic Acids Research》上的关于COSMIC v86 新版本的一篇文章，对 COSMIC 数据库功能和...
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常用实验设计方法（DOE）介绍实验设计介绍 Design Of Experiments(DOE) 进行实验设计的目的： •快速达到最好的结果 •省略不必要的试验 •给最好的精确结果 •进展没有失败 •建立...
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Python数据可视化（七）：箱线图绘制
使用seaborn包绘制箱线图[#%E4%BD%BF%E7%94%A8seaborn%E5%8C%85%E7%BB%98%E5%88%B6%E7%AE%B1%E7%BA%BF...
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卡方检验、T检验+F检验、方差分析、Z检验1、卡方检验： 卡方检验是用途非常广的以卡方分布（深入浅出统计学有讲）为基础的一种假设检验方法，它属于非参数检验的范畴，主要是比较两个及两个以上样本率( 构成比）以及两个分类...
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非参数检验：Wilcoxon检验引言 Wilcoxon检验（也被称为Mann-Withney-Wilcoxon检验）是一种非参数检验，意味着它不依赖于属于任何特定参数的概率分布家族的数据。非参数检验的目标与...
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生信课程笔记7-基因区间和注释资源Summary 1.Bioconductor注释资源 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 人类的全基因组序列TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38...
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机器学习基础（1）- ROC曲线理解本文用于理解ROC曲线的定义，绘制过程及其应用实现，主要用于自我温习回顾基础 基本目录如下： 什么是ROC曲线？1.1 ROC曲线的历史1.2 ROC曲线的定义1.3 ROC...
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什么是协变量Covariate？如何控制随机对照研究中协变量的影响
初学者非常迷惑，很多英文SCI经常出现Covariate。什么是Covariate？它在统计分析中扮演什么角色？如何控制它的不良影响呢？ 协变量是指不同干预措施前，研究者预计...
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三代变异检测操作说明-DeepVariant
作者：Charon审稿：童蒙编辑：amethyst 众所周知，三代测序的单碱基测序错误率远远高于二代测序，PB的单碱基错误率有10-15%，而ONT也有5-20%[1]，那么...
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生存分析（Survival analysis）的总结整理
生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断，研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法，也称生...
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利用sklearn做ROC曲线注意：画pr曲线可以参考http://www.cnblogs.com/aquastone/p/random-classifier.html 对matrix或array型数据做...
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16型人格性吸引力大揭秘！
关注MBTI下午茶，获取更多有趣的MBTI内容。 无论你在网上说自己多么喜欢哪些人格，无论网上的大家在嗑哪些mbti的cp，都是网络情缘一线牵！ 但要说性吸引力的话，还是得在...
