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【R语言】解决GO富集分析绘图，标签重叠问题前面小编给大家详细介绍过 ☞GO简介及GO富集结果解读[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%...
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作者大大，请问定量分析那里筛选出显著相关且相关系数的绝对值大于 0.6 的基因，0.6我筛出来的基因太少没有显著富集的通路，可以改成0.1吗，这样合理吗？
TCGA 数据分析实战 —— GSVA、ssGSEA 和单基因富集分析
前言 前面，我们介绍过了差异基因的功能富集分析，今天，我们对这部分的内容作一些补充 主要介绍一下 GEVA、ssGSEA 和单基因的富集分析 GSVA 我们知道，GSEA 富...
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gelnet(X, y, l1, l2)
Error in gelnet(X, y, l1, l2) : Unknown label type
y must be a numeric vector, a 2-level factor or NULL，请问这个怎么解决呢TCGA 数据分析实战 —— 干性指数（mRNAsi、mDNAsi）
前言 干细胞(stem cells, SC)是人体内具有自我复制和多向分化潜能的原始细胞，而这种自我更新和分化为成熟细胞的能力称为干性 肿瘤干细胞 (cancer stem ...
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请问你解决了吗
cMAP新版clue的使用——query
之前在Connectivity Map(cMap)的探索应用（二）中提到了两种cmap在线分析网站，一个是build2 ；另一个是CLUE平台。bulid2在cMAP在线分析...
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你好，我的计算量太大，您文章中说的用亚群的平均表达量来计算具体应该怎么做呢？
ReactomeGSA：高效的单细胞通路分析工具
前情提要： SPATA：基因集驱动的空间转录组分析框架[https://www.jianshu.com/p/81ce67b27529]enrichplot||基因富集结果可视...
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差异分析|使用limma包获取本章节数据和代码：关注微信公众号：小杜的生信筆記（ID：Du_Bioinformatics），回复关键词：limma差异分析 ----------------------...
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单细胞转录组技术构建肝细胞癌的免疫抑制谱人肝细胞癌是一种高死亡率的原发性肝癌，也是全球范围最常见的恶性肿瘤之一。遗传、表观遗传改变和病毒感染是肝癌的主要诱发因素。由于复发和转移率高，肝细胞癌的死亡率较高。为了研究人...
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GEO数据挖掘-第四期-肝细胞癌（HCC）
文章来源：生信技能树原文：GEO数据挖掘-第四期-肝细胞癌（HCC） 疾病背景 肝细胞癌（HCC），起源于肝细胞，是全球第七大常见癌症。 每年全球约诊断HCC病例50万例，约...
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单细胞分析实录(12): 如何推断肿瘤细胞
公众号后台回复20210418，获取本文的测试数据 1. 回顾 前面我已经讲解了inferCNV的基本用法[https://www.jianshu.com/p/c01f56b...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
