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DESeq2差异分析十全大补使用笔记写在前面：新手老菜鸟，个人心得，不足之处欢迎交流指正；写作不易，转载前请联系我征得同意，谢谢。 1.基本原理 1.1 概述 全称：DESeq2 package for dif...
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RNA-seq入门实战（四）：差异分析前的准备——数据检查本节概览：数据预处理, 进行样本间具有可比性boxplot查看样本的基因整体表达情况查看不同分组的聚类情况：样本hclust 图、距离热图、PCA图、差异基因热图、相关性热图...
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R可视化之ComplexHeatmap【二】：行（列）顺序、行（列）名特别声明：本部分（系列）内容均来自顾祖光博士对ComplexHeatmap的介绍，仅为学习交流，尊重原创。 热图系列我们已经有： R可视化之ComplexHeatmap【一】...
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浅浅的学习历程<br>生信新手，打工人，搬运工。<br>像王子文一样财务自由，才可实现生育自由<br>像李子柒一样把一件事情做到极致，才可实现职业自由
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富集分析GO，KEGG，DO等市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff ---> R tophat2是把reads回帖到基因组上；...
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Transcript ID（ENST/ENSMUST/NM_123456）转换为gene ID（ENSG/ENSMUSG/Gene ID）和Gene name/Symbol----前不久拿到公司给的转录组测序结果，Gene ID是以ENMUST开头，查了一下，ENST为EMBL 核酸数据库中人类的转录本ID，ENMUST为鼠的转录本ID。一般我...
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学生信的那些事儿之二 - （小白）怎么学生信
只有当一个人对自己失去信心的那一刻，他才是真的过时了。——《飞驰人生》 什么是生物信息学 生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分...
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【康华同学】:优秀生物信息学博客 专注收集优秀的生物信息学博客，欢迎广大博客主投稿！
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PCR、RT-PCR、qRT-PCR实验精髓
PCR PCR是很多科研者进入实验室做的第一个分子实验，名字听起来很高级，其实操作起来流程还是比较清晰明了，容易上手。聚合酶链式反应(Polymerase Chain Rea...
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最近整理了几类常用的绘图代码最近比较忙，所以有段时间没有更新了，后面多多更新，再补过来! 之前整理了关于热图的绘图代码，包括常规热图，和个性化加标签的热图，刚好最近有小伙伴说能不能整理几个常用的绘图代码...
