发简信
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【小工具】R 画venn图 二个三个四个五个数据： 待比较的数据以文件形式存储，且每行是一个单独的数据。注意文件名格式建议以“.”分隔：A.txt，B.txt，因为A和B将用在图中。比如： 功能： 1）两个，三个，四个...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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浅谈统计检验的效能和假阳性最近写的文章，朋友过目后提出的问题让我自己感觉到本科阶段的学习没有做一个非常好的总结，应付完考试之后，早已忘到九霄云外，现在的我通过写博客，一点一点找回来。 什么是统计检验的...
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【R语言】ggtree绘制进化树绘制进化树的方法有很多，入门的MEGA。美化比较好用的，也是我经常用的工具如iTOL，evolview等。 今天测试了另外一个别的paper和笔记中经常用的的一个R包：ggt...
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Hyphy，不亚于Paml的选择压力分析的优秀软件，使用指北
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下几大优点： 操作使用简单。 运...
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数据处理，分析与展现，R语言编程，Python, 图表制作，基于数据的决策与执行,算法。Life is short, use Linux.
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在线工具网站，生物分析的一些网站或者数据库之类的文章。🎻相关的文章会在收录时间上相近，请点击『最新收录』 🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡 🕸 数据库，比如Ensembl、Phytome 🕸 癌症分析网站，比如GEPIA、cBioportal 🕸 系统发育树的美化，比如iTOL 🕸 基因注释，比如Metascape、KASS 🕸 蛋白质结构预测，比如pfam、SMART 🕸 在线绘制统计图，比如Venny 🕸 序列比对，比如blast 🕸 引物设计，比如primer3、primer-blast 🕸 文献下载，比如sci-hub，文献鸟 🕸 。。。
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
