(十)、分析流程及软件列表 有参转录组:针对有参考基因组序列的物种进行 mRNA 的分析。 无参转录组:针对尚无参考基因组序列发布的物种进行 mRNA 的分析。 DGE:数字...
(九)、分析内容相关 gene annotation:基因注释,分为基因的结构注释和基因的功能注释。 CDS predict:CDS(coding sequence)序列是编...
(八)比较转录组学相关 比较转录组学:(Comparative Transcriptomics)是一种快速、全面解析不同品系,不同亚种进化关系,以及特定组织表达情况和关系的生...
(七)分子标记相关 分子标记:是遗传标记的一种,直接在 DNA 分子上检测遗传变异。分子标记能对不同发育时期的个体、组织器官甚至细胞作检测,数量极多,遍及整个基因组,多态性高...
三、建库测序相关: library construction:文库构建,高通量测序前准备步骤。针对不同的研究目的建库方法不同。通常包括核酸样品检测、片段化、(扩增)、加接头、...
参考De novo 测序基础知识 - Life·Intelligence - 博客园 (cnblogs.com)[https://www.cnblogs.com/leezx/...
测序知识 思维导图 名词解释 以下摘录自生信星球 1.基因组学(核酸序列分析) (1)全基因组测序(WGS)(2)全外显子组测序(WES)(3)简化基因组测序(RRGS)①R...
测序深度(Sequencing Depth) 相当于测了几遍; 指测序得到的总碱基数(bp)与所测物种基因组大小的比值,其是评价测序量的重要指标之一; 如:测序产生了1000...
1、Read depth Read深度:一个样本测序得到的reads数;容易和基因组测序的覆盖度 (多少基因组区域被测到了)和测序深度混淆 (单个核苷酸被测到的次数或所有核苷...
问题 Paired-End测序与Mate-Pair测序相对于单端测序有何优势? Paired-End中的Read1和Read2到底是啥关系?它们是如何参与拼接和比对的呢? M...
原作者:https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11596253.html https://www.cnblogs.com/leezx/p/5590...
来源:https://zhuanlan.zhihu.com/p/91913739[https://zhuanlan.zhihu.com/p/91913739] 第二代测序原理...
2021.3.9持续更新中。。。主要参考:生信曲线[https://www.bilibili.com/video/BV1oa4y1H7CU?t=31]、基因学苑[https:...