Structurestructure下载地址[https://web.stanford.edu/group/pritchardlab/structure.html] Stru...
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一、简介 Structure 是一个利用遗传标记推断群体遗传结构的软件。其功能包括推断群体数目,判断某个个体属于哪个群体,鉴别迁移个体及杂合体等。举个例子 上图中颜色的种类即...
一、基因组下载及索引构建 1.1下载基因组 我下载的是支原体基因组,http://bacteria.ensembl.org/index.html[http://bacteri...
shenwei爪哥开发的处理Fasta/Fastq文件的万能工具。之前处理fq/fa文件时花时间写的一些脚本发现在seqkit里直接能一行命令就解决。实在是提升效率,整合流程...
在拿到一组snp数据时,首先应该想到要对snp数据的质量进行检测和控制。然后再考虑这组数据该怎么分析,如何分析。snp的质控是非常重要的,如果snp数据的质量不佳,那么计算的...
查看fastq总体信息 root:~/refs# seqkit stat duplicated-reads.fq.gz seqkit fx2tab 1.取序列名seqkit ...