写在前面 早前已经推过《新手eggNOG-Mapper详细教程》，但仍然有很多人遇到使用问题。换句话，可能那个教程不能彻底解决大伙遇到的问题。于是我决定写一个完美的教程，彻底...
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零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM... -
2023-12-23GO&KEGG富集分析eggNOG-mapper功能注释eggNOG-mapper功能注释 http://eggnog-mapper.embl.de/[http://eggnog-mapper.embl.de/] eggNOG (...
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E. coli ST1193比较基因组文章 标题：Phylogenetic Analysis Reveals Distinct Evolutionary Trajectories of the Fluoroqui...
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R数据可视化: PCA和PCoA图, 2D和3D前言 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也称主分量分析或主成分回归分析法，是一种无监督的数据降维方法。PCA通过线性变换将原始...
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[R语言可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析（PCA）本期内容为[R语言可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析（PCA） 主成分分析：PCA（Principal Component Analysis）是一种常用的数据分析方法。...
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R语言计算β多样性指数及分析计算β多样性指数需要用到phyloseq包。它的安装方式不同于简单的install.packages（“phyloseq”） 有两种方法可以安装 1.先安装BiocManag...
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R语言：unifrac的计算
Unifrac是一个十分常用的衡量不同群落之间谱系结构差异的指标。在R语言中，计算unifrac的函数不只一种，不同函数之间有什么差别呢？本文目的就是对几个常用的计算unif...
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R：Bray-Curtis PCoA导读 Bary-Curtis PCoA降维分析菌群结构。 一、输入数据 1.1 菌属丰度矩阵 1.2 样品分组 二、BC PCoA函数 三、分析及结果 3.1 结果文件 3....
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7. vegan包进行PCoA分析和可视化简介 PCoA分析，即主坐标分析（principal co-ordinates analysis），是一种非约束性的数据降维分析方法，可用来研究样本的相似性或差异性，与PCA...
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当物种组成柱状图配上聚类数前两天在公众号植物与根际微生物生态看到一篇转载的文章，关于聚类与物种组成柱状图的： 翻看了作者的代码，基本是用R base写的，我想着能不能用Y数的ggtree结合ggpl...
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ggplot2绘制Alpha多样性指数图经过前面几节的原始数据处理过程，得到了可以用于分析的数据，现在让我们开始微生物组数据分析可视化的第一步，绘制Alpha多样性指数图，喜欢的小伙伴欢迎关注个人公众号R语言数据分...
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16S测序分析（六）用PICRUSt预测菌群KEGG代谢通路
导读 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved S...
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16S测序分析（五）用RandomForest寻找关键细菌导读 用随机森林“分类”的方法寻找16S测序数据中与分组有关的细菌。 一、数据准备 标准化细菌丰度表格式要求：不用放样本ID；最后一列放分组变量 二、R分析准备 三、随机森林...
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SpringBoot+Vue前后端分离（CURD）Demo我发现我好久没有更新了，写一篇证明我还活着。既然是前后端分离的话，肯定是要有前端和后端的。这里前端我使用的Vue+ElementUI,后端采用的是SpringBoot+Myb...
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Vue3写一个后台管理系统（4）RBAC权限受控体系的实现一、RBAC 权限控制体系 要实现动态Menu，我们需要先来统一一下认知，明确项目中的权限控制系统。网上找了张图，我们可以大致的看下 从图中，我们可以简单的这样理解RBAC ...
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vue2.0 + element-ui 多级导航菜单自从用饿了么框架重构项目以来，遇到 很多问题，我都有一一记录下来，现在特喜欢这个框架，说实话，如果你是用了vue这个技术栈的话，一定要用饿了么的pc端框架哦，遇到问题的时候在...