IP属地：湖南
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群体遗传笔记（一）：群体间选择信号的检测及GO注释从获取下机数据做质控、比对，到calling snp获得vcf文件这一步，网上已经有非常详细的教程，有GATK4.0和全基因组数据分析实践（上），还有Samtools+bcf...
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2021.11.19 | 群体遗传结构、PCA、进化树
常见的群体结构的分析方法有admixture分析、系统发生数分析以及主成分分析等。 1、admixture分析 1）R语言绘图 admixture的可视化分为两种 2）pon...
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学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
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15.KEGG富集分析R语言代码及5种图的绘制一、举例回顾 本节所使用GSE1009数据集，已经用limma包进行差异分析，现对DEGs做GO富集分析。 GSE1009数据集介绍： 样本量：共6个样本，其中后3个为糖尿病...
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对SNP的VCF文件质控筛选对SNP的VCF文件质控筛选 1.vcfR简介 vcfR is a package intended to help visualize, manipulate and qu...
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snp密度图、treemix、D检测snp密度图 treemix画图ML树 D检测 （ABBA-BABA test） IGV 读取bam文件 IGV导入基因组和bam文件。genomes>load from f...
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