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    转录组分析进阶

    这是我听孟浩巍知乎LiveB站鲮鱼不会飞视频(转录组分析进阶课程)里的笔记哦~ 本次知乎Live解决的问题: 转录组的建库与质量控制 人类基因组与转录组组成 转录组的2种建库...

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    四. 基因组数据可视化(BWA, Minimap2, samtools and IGV)

    一. 简介 在基因组数据分析过程中,我们可以将fastq,fasta,ONT等不同格式的数据mapping到参考基因组上,然后通过IGV进行可视化,结合GFF3文件手工对感兴...

  • hisat2比对转录组数据

    目前hisat2是最流行的转录组比对软件,其比对速度快,且准确度较高。具体使用方法如下:用到的软件版本为hisat2-2.2.1,samtools-1.6 1. 构建hisa...

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    RNAseq常规流程

    转录组分析是生信分析的一个基础和常见的分析流程,一般从下机数据开始,经过一系列的质控,基因组比对,差异分析等过程得到实验组与对照组(或者肿瘤中的转移组和原癌组)中差异表达的基...