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WGCNA分析，简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...
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蛋白质组学数据的缺失值填充
缺失值填充在数据分析领域的预处理过程绕不过去的一个坎，蛋白质组学也不例外，简单记录下，可能有些地方有其特殊之处。 分析缺失值来源：完全随机缺失（MCAR，如质谱仪抖动，对数据...
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DIA技术及其软件工具介绍前言 关于蛋白质组学，你是不是已经听了太多公司的宣讲，介绍了一大堆的技术名词，反而越听越懵懂，脑袋一团乱麻？就和传话游戏一样，当我们接收了多手信息以后，得到的信息就越不准确。...
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【1】蛋白质组学鉴定软件之X!Tandem1. 简介 X!Tandem是GPM：The Global Proteome Machine（主要基于Web的开源用户界面，用于分析和显示蛋白质鉴定数据。关于GPM的更多内容...
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颜值够格的风险森林图0.输入数据和R包 在生信星球公众号聊天框回复“forest779”即可获得输入数据。也可以自己根据表达矩阵与临床信息生成，如下： 1.多因素cox回归 建模就一句代码，出森...
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cox的predict结果与加权乘积居然不一样1.问题起源 predict的参数type默认值就是“lp”，代表线性模型，理论上和大量文章里描述的公式应该是结果相同的。比如这个： https://www.ncbi.nlm...
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基因长度并不是end-start需求 tpm、fpkm这样的数据，计算公式里都有“基因有效长度”，有些地方直接叫基因长度。之前计算这些，都是采用最快的方式—找豆豆。今天想要把这部分逐渐加到课程里，我就必须要...
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生信技能树蛋白组文章汇总
1. 蛋白质组学第1期-认识基础概念 2. 蛋白质组学第2期-认识蛋白质组学原始数据 3. 蛋白质组学第3期-蛋白质组学的三大元素 4. 蛋白质组学第4期-文章搜库过程复现 ...
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fasta和fastq格式文件的shell小练习作业中参考了：https://www.jianshu.com/p/bc1fe435879c https://www.jianshu.com/p/d10a85f21889 ht...
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浅浅的学习历程<br>生信新手，打工人，搬运工。<br>像王子文一样财务自由，才可实现生育自由<br>像李子柒一样把一件事情做到极致，才可实现职业自由
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非肿瘤纯生信：冠状动脉的分子亚型轻松4+分
大家好，今天和大家分享的是19年1月份在J. Cell. Physiol(IF：4.522) 上的一篇文章，"Identification of the molecular ...
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6+非肿瘤纯生信，结合机器学习，免疫浸润以及分子分型，不到两个月接收，可重复！影响因子：6.2 从投稿到接收不到2个月 关于非肿瘤生信，我们也解读过很多，主要有以下类型 1 单个疾病分析 2 单个疾病结合免疫浸润，铁死亡，自噬等相关分析 3 两种相关疾...
