使用检索式：(Actinodaphne acuminata) AND 5.8S 或者(Actinodaphne acuminata) AND internal transcr...
IP属地：江苏
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如何在NCBI下载ITS序列
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0/1型是怎么转化的呢？
使用R语言对SSR数据做主成分分析（PCA）的一个简单小例子
昨天的推文介绍了使用R语言对比对后的DNA序列做主成分分析的一个简单小例子，推文下有朋友留言问如何对0,1矩阵做主成分分析（PCA）查了一下参考资料找到了一个办法 参考资料的...
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请问可以分享一下自然保护区的地图吗
自然保护区相关矢量数据下载(修改)
获取自然保护区等数据过程 ArcGIS online在ArcGIS中加载 ArcGIS online中国自然保护区及生态功能区的相关数据可以在arcgis中添加feat...
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请问可以出一个fastsimcoal的教程吗？
动物驯化及群体历史研究
●与驯化相关的研究热点主要集中在：家养动物何时何地被驯化？驯化途径是什么？驯化表型是什么？与驯化表型相关的基因有哪些？家养动物驯化地点大致主要集中在三个地方：近东地区、中国中...
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BITE package的安装BITE 包的安装：BITE: BioInformatics Tools for Everyone Github地址：GitHub - marcomilanesi/BITE:...
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Rtools的安装与配置
1.下载相对应R版本的rtools，我的是R v4.2.1故而下载rtools为RTools42 RTools: Toolchains for building R and ...
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您好，想请教您关于遗传多样性软件 CLUMPAK的使用，我也打不开结果链接
遗传多样性软件 CLUMPAK 使用说明
CLUMPAK是一个perl脚本，需要提前按照说明书使用cpanm或conda安装所需模块官网[http://clumpak.tau.ac.il/index.html] st...
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您好，我在进行分析时发现mutation rate一直都是1，但是我在准备.xml文件时选定了范围为（0，1），您知道这是什么原因吗？
Phylogenomic_Tutorial || Bayesian Phylogenetic Inference
"Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【二】贝叶斯树的构建及基础贝叶斯分化时间推断" [TOC] Baye...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
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SNP数据的AMOVA分析 和 Mantel分析一 AMOVA分析 1 将 VCF 转换为 arp 格式，定义population PGDspider软件 2 导入Alrequin 并定义group 3 starting ...
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临床数据分析、数据可视化、机器学习、Python/R<br><br>Github：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fgithub.com%2Fjamesjin63" target="_blank">https://github.com/jamesjin63</a><br>欢迎关注我们的公众号：EpiHub
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中国官方最新地图下载(付源码 2022版)前言 我们在进行数据可视化，或者发表文章时候，如果碰绘制中国地图问题，请记住，一定要使用中国标准地图。 但是，平时网上的案例，或者下载的地图，都是缺失台湾或者西藏交界有缺失，...
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跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2散点图及多图共享图例论文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
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Tajima's D 绘图
1.计算Tajima's D 通过vcftools对不同物种的Tajima'D进行滑窗计算: vcftools --vcf str.vcf --out pop1.tajima...
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老师您好，我用easySFS的到了SFS文件（24326.84472308741 348.822624271156 283.9606422988769 303.655707038062 424.0933086521348 258.6229946524078 0 0 0 0 0），我删除了d0和后面的0值后运行stairway_plot，但是一直报错SFS error: shall have nseq-1 numbers，N+1后的0值不可以删除吗？
种群动态历史评估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）
SFS的基本理解、介绍的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
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使用linux版本可解决，命令运行
SNP数据的AMOVA分析 和 Mantel分析
一 AMOVA分析 1 将 VCF 转换为 arp 格式，定义population PGDspider软件 2 导入Alrequin 并定义group 3 starting ...
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请问关于fastsimcoal2的使用和建模可以请教一下吗？
Stairway-plot群体动态图
一 首先用BayesScan删除受选择的位点1.输入文件：PGDSpider将VCF 转为GESTE/BayScan格式，即下面的bates.xml2.运行命令 3.输出文...
