轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...

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安装所需要的R包 加载所需的R包,并将默认主题设置为theme_bw(),并将图例放在图的顶部 创建一些基本图像: patchwork包水平拼接 垂直布局可以通过向plot_...
数据库中定义了已知的基因集合: 包括H和C1-C7八个系列(Collection),每个系列内容为: H: hallmark gene sets (效应)特征基因集合,共...
trainControl中两个的意义 repeats 重复次数 number 几折 trainControl(method = "repeatedcv", ...
系列回顾:1.RNA velocity分析练习(一)文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习(二)软件安装 Velocyto软件针对不同测序平台,有不同的方法进...
刘小泽写于2020.7.15为何取名叫“交响乐”?因为单细胞分析就像一个大乐团,需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExperiment单...
linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是一个Python下和Canop...
按照惯例每年生日都会写一篇文,但是今年6月的时候没有太多的想法,所以就搁置了,时隔2个月,终于有了起笔的想法。 看了看上一年的日志,我想在去年写日志之时,无论如何都不会想到今...
上一篇文章深入学习了Monocle2包,这次来继续学习Seurat包。Seurat官方网站:https://satijalab.org/seurat/v3.1/pbmc3k_...