笔记内容：由二代测序产生的序列数据（fastq格式）到物种丰度的OTU table， 样本群落距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的分析结果，为常规分析流程。...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：从fastq测序数据到OTU table -
R语言中dplyr包join函数之目前我看到过的最形象的教程所涉及的函数 Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
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基因组注释文件（二）| gff 和 gtf文件格式说明
简介 GFF和GTF是两种最常用的基因组注释格式，在信息分析中建库时除了需要fasta文件一般还会需要这两种文件，提取需要的信息进行注释。 一、GFF GFF(General...
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Hi-C技术的初步了解最近的一次组会上看到实验室的同学汇报的结果里有Hi-C的图，所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技术的原理。整理一下。 Q1: Hi-C的全称是什么？ A: 高通量染色体构象...
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Dream it. Wish it. Do it.【送给所有支持我的小伙伴们】距离第一篇简书笔记（2019-8-20）已经一年有余了，本来是想在一周年的时候写一篇心路历程的，后来一想，还是等到粉丝数破千的时候再写更有意义。因为正是这些支持我的小伙伴们的...
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海外博士申请总结 - 准备材料之个人陈述篇本文唯一作者为Bright新人类，如需转载，请先发简信通知谢谢 在上一篇文章中，我们详细介绍了博士申请过程中简历如何撰写以及具体可以通过什么平台来撰写简历， 希望能给你一些参...
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最大简约法（Maximum Parsimony）选择最优树——NP-complete问题 （以下内容都是基于Christopher P. Randle教授在研究组上交流时的课件整理而来。感谢Christopher。） 在介...
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第九章 魏斯曼与老鼠的尾巴
拉马克，一个在生物进化理论历史上很憋屈的人，不论在生前还是生后。 他比达尔文更早提出进化论，但是，他的“用进废退”、“获得性状遗传”进化学说大多数时间里受到达尔文的“随机变异...
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rgene_gamma计算2023-10-02rgene_gamma计算，准备如下两个文件，以及ctl配置文件 树文件：请注意，根节点需要一个简单的化石校准，比如“@4.5”（450Ma ago）。如果没有这个标记计算出...
