一、背景 有的时候，我们需要手动对结果文件(可能是vcf，xls，或者其他形式)进行bed文件的过滤，这时候如何高效准确的对posi是否在目标区域内，成为关键。 二、关键点 ...
发简信
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使用二分查找进行bed区域过滤
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我比较懒没往下写，李金明先生主编的《高通量测序技术》一书有细节，你要是愿意看的话，给我留个言，我都更新上
菜鸟搭建有参转录组分析流程
文章参考于李金明先生主编的《高通量测序技术》一书 一、样本的选择 本次的样本来源于小鼠8个不同的组织（每个组织两个重复） 数据来源于SRA数据库（PRJNA177791）样本...
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网易企业邮箱如何配置foxmailFoxmail是电脑中非常好用的邮件管理软件，但对网易企业邮箱显得并不友好，经常尝试多次也无法成功配置。终于我废了九牛二虎之力，成功了，现在满含激动的泪水，和大家分享一下。 ...
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《利用Python进行数据分析·第2版》第1章 准备工作《利用Python进行数据分析·第3版》新版上市[https://u.jd.com/W8xSkzl]，新版使用的是Pandas 1.4，更新了不少内容。为了帮助大家学习，这次...
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Sanger 测序，NGS 测序，数据分析
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RNA-seq 检测变异之 GATK 最佳实践流程
tags： RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比对 对 RNA-seq 产出的数据进行变异检测分析，与常规重测序的主要区别就在序列比...
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RNA-seq: Kallisto+Sleuth(1)本文我们来简单介绍一下非常快捷好用的一个RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推荐的原因是其速度非常快，在我的Mac Pro就可以运行使用，而且其结果也比...
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我就单个样本用delly filter过滤过，一弄就是空空如也，O(∩_∩)O哈哈~
CNV calling | DELLY
基于paired-end mapping methods 和 split-read analysis，检测结构变异。 写在前面 Delly is an integrated ...
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CNV calling | DELLY基于paired-end mapping methods 和 split-read analysis，检测结构变异。 写在前面 Delly is an integrated ...
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如何下载TCGA数据/TCGA数据下载小教程1. 什么是TCGA？TCGA中有哪些数据？ TCGA的全称是The Cancer Genome Atlas, 这个项目始于2005年，它旨在使用基因测序和生物信息学编目与癌...
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SnpEff 配置基因组注释文件
SnpEff 软件提供了绝大多数物种的基因组注释信息，但随着基因组版本的不断更新和新的更好的基因组的出现，我们有时需要将新的参考基因组注释信息添加到其本地数据集中，本文是我再...
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