一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息，多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它们的联系与区别 -
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【R画图学习13.4】散点图---单细胞不同亚群火山图下面这个图是我在单细胞相关文章中见过的，也算是火山图的变种。可以看出X轴是不同的细胞类型，Y轴是marker基因的fold change（log2）,但是不同类别之间他们是不...
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R语言Cibersort文件获取+代码在R语言中运行Cibersort共需要三个文件，分别是（1）官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表达矩阵；（3）Cibersort代码。 （1）LM2...
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cibersort报错解决
杀杀 使用cibersort报错了，提示warning，还有cibersort Error in h(simpleError(msg, call)): 在为'sort'函数选...
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【文献解析】替莫唑胺诱导的超突变与IDH突变低级别胶质瘤的远期复发与生存率降低相关《Temozolomide-induced hypermutation is associated with distant recurrence and reduced s...
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胶质瘤化疗临床实验简介汇总
杀杀 汇总胶质瘤化疗药相关的II-III期临床实验以及大致简介 Temozolomide（TMZ A randomized phase III Intergroup stud...
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R语言多因素cox回归构建预测模型杀杀 （第一步不作赘述，一般会使用单因素cox或者寻找差异基因等方法，筛选与生存相关的分子，准备进行下一步的模型构建） 本篇举例是筛选了12个单因素cox与生存显著相关的分子...
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R语言KEGG通路信息下不下来怎么办
杀杀报错信息：Error in download.KEGG.Path(species): 'species' should be one of organisms l 再运行...
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服务器Jupyter Notebook和Samba的安装及部署——by不是杀杀Samba是在Linux和UNIX系统上实现SMB协议的一个免费软件，由服务器及客户端程序构成（来自百度百科），简单来说它可以实现服务器端（Linux）与Wi...
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不会生信哟 ·请问最后输入结果return(max(data[length(nums)-1,1],data[length(nums)-1,2])),其中max的比较为什么是在length(nums)-1行，而不是length(nums)行呢？
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R语言拼图（含生存分析），R语言画布设置
杀杀 发一些拼图的小技巧 拼图之前，先要根据自己图片的张数，设置好画布大小，这很重要我画图的经验中，正常一张方形的图会设置为width和height都等于5，如果两张横着拼在...
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R语言拼图（含生存分析），R语言画布设置杀杀 发一些拼图的小技巧 拼图之前，先要根据自己图片的张数，设置好画布大小，这很重要我画图的经验中，正常一张方形的图会设置为width和height都等于5，如果两张横着拼在...
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KEGG通路数据库下载(人种)
方法一在MSigDB下载，网址GSEA | MSigDB | MSigDB Collections。下载到 gmt 格式文件使用 GSEABase 包的 getGmt 函数读...
