
看到一个可进行物种分歧时间估计的方法,是PAML中的一个子程序mcmctree。在此记录。 标题:PAML 4: phylogenetic analysis by maxim...
导读 基因岛(Genomics Islands,GIs)是一些细菌、噬菌体或质粒中通过基因水平转移整合到微生物基因组中的一个基因组区段。一个基因岛能与病原机理、生物体的适应性...
导读 开始有关病毒的基因组学研究。 分析工具特点发表杂志发表时间被引(2021)VirSorter组装,PERLPeerJ2015585VirSorter2组装Microbi...
PGCGAP 是用于原核生物基因组学和比较基因组学分析管道,目前该管道包含 12 个模块,可以接受 Illumina 双端 reads、Oxford reads 或 PacB...
001 怎样理解新的知识 通过联系已知的概念来理解新的概念,比如要想理解”笔记本电脑“的意思,你就要先知道”笔记本“和”电脑“这两个概念。 这和炒菜很像,我们的理解是在已有知...
gzh原文点我,欢迎同时关注[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIwODAxMzc5Mw==&mid=2247489477&idx=1&s...
最近比较忙,所以有段时间没有更新了,后面多多更新,再补过来! 之前整理了关于热图的绘图代码,包括常规热图,和个性化加标签的热图,刚好最近有小伙伴说能不能整理几个常用的绘图代码...
自然选择是达尔文进化论的核心思想。在自然选择的推动下,生物群体可能逐渐适应环境,提高自身适应性,从而实现进化;也可能被环境淘汰,进而导致灭绝。在自然选择和进化能力的关系上有两...
导读 比较平均核酸一致性average nucleotide identity(ANI)和氨基酸一致性amino acid identity(AAI)是比较基因组常用的两种基...