环形图大家都会绘制,但如何绘制出这种分段的环形图表达呢? 我们赶紧给大家show一下制作肌肉。相信大部分小伙伴都想到先画一个环形,但其实牛闪闪觉得先画下面的图形最先,上图的环...
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Smart-seq2 Smart-seq是由路德维格癌症研究所的 Rickard Sandberg实验室[http://sandberg.cmb.ki.se/]所开发的一套在...
Smart-seq: Smart-seq2的前身是Smart-seq,它是首个用于单细胞转录组测序的方法。Smart-seq的提出可以追溯到2012年,它的原理是通过在反转录...
最近试了很多Smart-seq2上游处理的方法,参照了Jimmy老师的教程[https://cloud.tencent.com/developer/article/16067...
这次跟着课程(Smartseq2 scRNA小鼠发育学习笔记-1-前言及上游介绍)要练习的文章是:Dissecting Cell Lineage Specification ...
本期内容同步发布于单细胞天地微信公众号。 回顾——细胞通讯网络构建 前面的帖子中我们已经成功地进行了细胞间通讯网络的构建,总的来看借助下面简易的分析流程即可完成: 今天继续介...
常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]:是公开的人工校正的,储存受体、配体以及两种相互作用...
0.背景知识 参考地址:https://bioconductor.org/help/course-materials/2005/BioC2005/labs/lab01/bet...
最近想将单细胞数据从Seurat转换到H5AD格式,但发现Seurat V5直接转换会报错。这里记录一下解决的方案。 直接转换会报错 Error in assay.group...