背景 双亲高度杂合（亲本由多个单体型构成）的分离群体利用常规的BSA分析方法往往结果并不理想，因为在混池中有多等位基因的干扰。OcBSA就通过解析两个杂合亲本的4条单体型在后...
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BSA分析（八）——OcBSA -
BSA分析（六）——QTLseqr包前言 我在犹豫是否补充一篇怎样拆分染色体进行比对和变异检测（主要是为了提高比对和变异检测效率）的帖子。开始没有规划这篇内容的原因有两点：一是内容比较简单，觉得可能用处不大；二...
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R语言 -- customLayout 包 拼图目标 使用R拼出这样的一张图： Let's start 1. 安装 customLayout 包 简单介绍一下 customLayout 包： lay_new(mat, wi...
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利用重测序数据Call SNP,并尝试构建遗传图谱
#构建ref genome index file bwa index genome.fasta genome vim sam_file.sh#!/usr/bin/envbas...
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使用MAKER进行基因注释(高级篇之GeneMark-ET模型训练）GeneMarkGeorgia Institute of Technology开发的一系列基因预测工具。真核生物基因组预测主要会用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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Biopython （一）安装与介绍
被朋友安利一个专门用于处理生物信息学的工具箱“Biopython”，别人用python开发的小工具直接拿来用用也是很省时省力的，好吧，学生信就从“调包侠”开始做起吧！ 因为刚...
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使用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包，看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档，加上了我的测试数据（还是以果蝇为例）。 一、...
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clusterProfiler导入失败解决办法最近在安装光叔的clusterProfiler包时，遇到了以下报错： 即可以正常安装，但不能导入。 显示错误：package or namespace load faile...
