博士在读，我会加油
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个人感觉分类方式一二更符合用户常规使用习惯，方式三往往难以进行分类界定且与用户常用分类习惯不太符合。而关于方式一二其实或许可以进行一些有机结合。如可视化模块本身的面向群体更大，较多为通用模块。而对于专业计算类，往往面向群体更小，或许可以有更细化的专业领域二层分类。
一种结合一二的个人想法的分类方式：
可视化模块
简洁文本处理模块
计算模块（根据二的进一步详细分类，操作台类也合并进此）
流程类
（以上一类可以作为menu中类似iTools的一栏存在）如果对eGPS软件中的模块进行功能的分类
有人说：鼠标点点点，绝对是后面生物数据分析的演化方向。 ------佚名 多功能生物软件eGPS(http://www.egps-...
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