sam转bam运行samtools view -@ 16 -b XXX.sam >xxx.bam后报错[W::sam_read1] parse error at line 1...
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避坑 sam转bam
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heatmap由于有太多NA无法聚类原因和解决方法有的时候数据中有NA，可以聚类出来，但是有的时候就会报一个这样的错误：“Error in hclustfun(distfun(x)) : NA/NaN/Inf in fore...
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菜🐣日记-转录组edgeR分析差异基因及案例演示菜🐣的第一次正式上手R，相当于翻译了 edgeR 这个包的 UserGuide，跑了第一个 case眼看写了这么多字，还是发一下比较好，万一有人看呢 edgeR简介 edge...
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找 illumina 接头序列1.https://support.illumina.com.cn/downloads/illumina-adapter-sequences-document-1000000...
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高通量测序中的接头（adapter）到底是什么主要参考 祝让飞 的文章及 Tufts 网站中的信息，特此致谢。 首先放一张测序示意图，在DNA片段两端所加的序列即接头序列，也就是我们今天要讲述的主角。 1 基本概念 1....
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HISAT2 Bowtie2 提取唯一比对 unique mapping reads
把read比对到基因组之后，需要提取唯一比对来进行下一步分析。 bowtie2和HISAT2 都没有只输出唯一比对的命令，所以需要对比对结果sam文件进行提取，可以通过sam...
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R可视化：使用R的circlize包绘制样本-物种丰度关联弦状图R作图-使用circlize绘制样本物种丰度关联弦状图 circlize图也即是弦图能较好展示样本物种丰度关联关系，先前从lyao222lll博客下载过该教程，但是最近刘老师...
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R语言circlize包画一幅好看的弦图~完整示例数据和代码前些天在网上看到的代码，他最终的出图如下 这份教程的链接地址是 https://www.royfrancis.com/beautiful-circos-plots-in-r/...
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文献精读-24nt-siRNA介导的DNA甲基化（RdDM）不定期更新Author: Marijori A. Matzke and Rebecca A. MosherJournal: Nature Review Geneticsdoi: 10....
