接触到一个生信分析项目,作者基于snakemake 串起了17个用python 脚本编写的分析流程。自己在搭建的Linux 环境下,测试了这些脚本。此文简要介绍snakema...
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转载:https://biozx.top/awk.html[https://biozx.top/awk.html] awk命令简介 awk是一个强大的文本分析工具,相对于gr...
转载:https://biozx.top/gtf.html[https://biozx.top/gtf.html] 参考 UCSC GTF format[http://gen...
这个非常受用,正好这里不是理解的特别清楚
要求 实现这个功能的软件也很多,还是烦请大家先自己搜索几个教程,入门请统一用htseq-count,对每个样本都会输出一个表达量文件。需要用脚本合并所有的样本为表达矩阵。参考...
转载:https://biozx.top/bed.html[https://biozx.top/bed.html] 参考 UCSC数据文件格式[http://genome.u...
Day 4 R language Install R and R studio Follow the instruction on the official website ...
1.认识R和Rstudio -先来画两个简单的图 plot()函数的使用[https://www.rdocumentation.org/packages/graphics/v...
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今天是学习的第二天!学习内容是入门linux,实际上是各种犯错误的一天(emmm)。不过学习就是各种犯错的过程~ 多练习多习惯! 1.什么是linux?什么是服务器? (1)...
1. 什么是conda? 简单理解的话conda就是Linux的应用软件商店,类似于Windows的360软件中心,而miniconda则是轻量级的conda,做生信的话已经...
Day 2 Linux常用代码 pwd (print working directory) 显示当前路径 mkdir (make directory) 创建空目录(文件夹) ...
1. xshell登录服务器 ssh 用户名@ip地址 2.Linux常用的基础命令 pwd: 显示当前所在路径 mkdir: 创建目录 ls: 显示列表 rm: 删除文件 ...
Day 1 解决学习中遇到的问题 搜索 谷歌、虫部落 搭建高效的学习平台 1.软件 浏览器:chrome文件搜索:everything截图软件:snipaste 2.学习笔记...
生信学习笔记 Day 1 任务 1. 下载软件 搜索软件 (Chrome) 任务 2. 思维导图 XMind 或者 幕布 任务 3. Markdown 运用 (笔记) 标题 ...