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linux shell中for循环，如何读取整一行
在处理一个多行数据的过程中，使用for循环去读取每行数据，结果发现输出是 shell中for循环的默认分隔符是：空格、tab、\n 一、若shell for 循环以\n作为分...
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Linux三剑客（awk-4）-awk的模式（pattern）
朱双印——awk从放弃到入门（6）：awk模式 我们之前一直在提，awk的使用语法如下： 对于options（选项）而言，我们使用过-F选项，也使用过-v选项； 对于Acti...
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【RNA-seq自学08】数据分析之表达定量 featureCount 、表达矩阵featuresCounts 软件用于定量，不仅可以支持gene的定量，也支持exon, gene bodies, genomic bins, chromsomal loca...
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宏基因组研究工具 | 小鼠肠道宏基因组目录(iMGMC)
近日，来自德国的研究人员在《Cell Reports》杂志发布了一个宏基因组研究的综合资源：小鼠肠道宏基因组目录(iMGMC)，为宏基因组研究提供高度集成的数据资源，并促进分...
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【宏基因组入门教程】（一）
最近接手了宏基因项目，会在之后接着发一系列的宏基因组入门教程，学习资料大概来自国外的教程。感谢Harriet Alexander, Phil Brooks, C. Titus...
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基因集富集分析(GSEA)及其可视化1 什么是GSEA 基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)是是一种计算方法，用于确定事先定义的一组基因是否在不同的样品中差异表...
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2022-05-24如何快速从基因组中提取基因、转录本、蛋白、启动子、非编码序列？
NGS基础 - GTF/GFF文件格式解读和转换这篇文章有读者留言想要提取外显子，内含子，启动子，基因体，非编码区，编码区，TSS上游1500,TSS下游500的序列。下面我...
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根据GTF画基因的多个转录本结构
外显子和内含子是转录本上面的概念，是基于转录这个行为的定义。 而5端UTR区域和CDS区域，还有3端UTR区域,是基于翻译这种行为的定义！ UTR（Untranslated ...
