测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw r...
你好,想请教一下,什么是数值化后的分类变量
TCGA+biomarker——单因素Cox回归生存分析KM法与Cox法异同 KM 方法即Kaplan-Meier survival estimate是一种无参数方法(non-parametric)来从观察的生存时间来估计...
今日学习重点 熟悉向量、数据框的使用 理解元素、标量、向量 变量赋值方法 从向量中提取元素 数据框的读取、设置行列名、导出、保存、加载 数据框中元素提取 利用数据框中数据作图
R语言基本操作 Rstudio界面 查看目录及文件 基本算术 赋值与删除 作图
Linux软件管理工具conda conda 相当于Linux的应用商城特点:方便快捷日常生信分析使用miniconda即可满足 下载及安装miniconda 下载1.1 进...
学习框架 什么是Linux Linux是一种操作系统,类似于我们常用的windows系统和Mac系统,但是Linux在普通计算机或者笔记本中应用相对较少,其市场主要集中在服务...
学习平台的搭建 chrome浏览器插件 由于本人电脑使用的chrome浏览器无法直接进入chrome的官方应用商城,自行网上搜索了其他方法,具体教程可见如下链接:chrome...
你好,我想请教一下,我按在运行model_lasso <- glmnet(x, y,nlambda=10, alpha=1)这一步时出现了下面的错误,应该如何解决?
Error in y %*% rep(1, nc) : non-conformable arguments
TCGA学习04:建模预测-lasso回归TCGA学习01:数据下载与整理 - 简书 TCGA学习02:差异分析 - 简书 TCGA学习03:生存分析 - 简书 TCGA学习04:建模预测-cox回归 - 简书...
你好,如果GEO没有提供整理好的ALL_data数据,只有10x数据应该怎么处理?(GSE136103)
生信技能树单细胞数据挖掘笔记(1)前言 最近有幸加入生信技能树的单细胞数据挖掘尝鲜群[https://mp.weixin.qq.com/s/3XyA-DXRzL8JuJlnV3LW0Q],借此机会给大家分享一...
请教一下楼主,如果整理的临床信息中存在缺失值应该如何处理?
TCGA数据差异分析后生存分析(批量单因素cox回归/Lasso筛选,多因素cox建模,时间依赖ROC曲线及KM plot可视化)测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw r...