关键词：表观年龄， 表观时钟，甲基化时钟，甲基化年龄，epigenetic clocks， Horvath clock 该博文主要介绍我们开发的一个基于甲基化芯片数据预测各种...
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表观年龄预测工具dnaMethyAge -
你考虑过computeMatrix的工作原理么?写在前面的话 你既然点进来了，说明你多半用过这个软件。但我猜，大多数人早期使用这个软件的时候，一定是赶鸭子上架：因为要画图，所以必须会。 但你真的懂了么？ 太长不看系列 对于...
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R数据可视化12:曼哈顿图曼哈顿图的名字来源是因为其形如曼哈顿的天际线：高耸在较低高度的“建筑物”上方的摩天大楼的轮廓。主要用于GWAS结果的展示，今天让我们来看看如何绘制曼哈顿图。 什么是曼哈顿图 ...
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生信笔记5-GWAS与eQTL引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段，彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析（Genome Wide Association ...
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空间转录组数据库汇总作者，Evil Genius 分享一个数据库，CROST, CROST应用标准化处理流程整合了182个高质量的空间转录组数据集，涵盖8个不同物种、35种组织类型和56种疾病的...
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免疫学笔记-1 | T细胞分化发育及其Marker1 关键细胞类型或Marker缩写： 骨髓多能造血干细胞 HSC 淋巴样祖细胞 lymphoid progenitor cell T细胞抗原识别受体 TCR 抗原提呈细胞 A...
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单细胞PBMC经典细胞类型marker背marker list 不要贪多哦，要慢慢地背，一个一个一个地背，然后背了再很快地忘记，如此反复。 外周血单个核细胞（Peripheral blood mononucle...
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Seurat取子集时会用到的函数和方法在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...
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单细胞转录组/AverageExpression平均表达是个啥
AverageExpression gzh：BBio Seurat中用于计算cluster基因平均表达值的函数，为啥这个结果和FindMarkers中差异倍数avg_logF...
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Cell Metabolism | Biological age is increased by stress and restored upon recovery
生物学年龄（Biological Age）：DNA甲基化时钟观察和评估基因组中各个位点的甲基化水平随年龄增长而发生的变化，从而评估其生物学年龄。 DNA甲基化时钟：维持DNA...
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文献阅读-《Tutorial: guidelines for the computational analysis of single-cell RNA sequencing data》文献名称：教程：单细胞 RNA 测序数据的计算分析指南文献期刊：nature protocols发表时间：2021-1-9 摘要 单细胞 RNA 测序技术 (scRNA-se...
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CellDancer细胞不会跳舞我不知道，但似乎nature biotech的文章代码会有毒。。。 CellDancer是最新发表在nature biotechnology上的一个类似scVel...
