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一、HiC-Pro 简介 HiC-Pro是目前比较流行的HiC数据标准化处理工具之一，其流程主要分为6个步骤，比对、过滤HiC比对结果、检测有效HiC序列、结果合并、构建Hi...

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学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...

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ggplot2包提供了分组和小面化（faceting）的方法。分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。ggplot2包在定义...

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基本数据管理 fix(leadership)来调用一个交互式的编辑器。然后单击变量名，然后在弹出的对话框中将其重命名 或通过names()函数来重命名变量。例如：names(...

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图形初阶 通过执行如plot()、hist()（绘制直方图）或boxplot()这样的高级绘图命令来创建一幅新图形时，通常会覆盖掉先前的图形。如何才能创建多个图形并随时查看每...

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R语言介绍 help("foo")或?foo 查看函数 foo 的帮助（引号可以省略）example("foo") 函数 foo 的使用示例（引...

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3.1 正则表达式 正则表达式 (regular expression) 是用来做模糊匹配的，匹配符合特定模式的文本。最早来源于 Unix 系统中的 sed 和grep 命令...

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Linux 下软件安装相关 2.1 文件属性和可执行属性 2.1.1 文件属性 文件属性 rwx 中 r 表示 read (数字表示为 4)、w 表示 write (数字表示...

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df -h ：查看硬盘有多大，有多少可用空间 cat是一个命令，主要用来查看文件；在这与 *<<END *连用用于读入大段数据。输入 cat <<END 之后，回车，会看到终...

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BLAST采用了一种局部序列比对的算法分析两个序列中的相似区域，并计算统计显著性。主要包括四大类：1. Nucleotide BLASTblastn: 将待查询的核酸序列及其...