翰佰尔生物HiOmics云分析

有标准10XGenomics格式文件想要进行hdWGCNA分析，需要依次运行三个工具完成整个流程。首先是Step2单细胞转录组质控及分群，将标准10XGenomics格式的b...

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16S在线工具可用于对扩增子测序数据进行分析，适用于16S、18S和ITS等扩增子测序项目。用户可以进入“云分析”或“宏基因组分析”页面，找到“扩增子测序分析(16S/18S...

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在单细胞转录组研究中，探究基因功能、解析调控通路、筛选潜在靶点是高频研究方向。传统基因敲除实验虽结果直观，但存在周期长、成本高、通量低、部分基因敲除致死等诸多痛点，极大限制了...

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本文适用人群：单细胞转录组初学者、需要批量挖掘GEO公共单细胞数据的科研从业者 适用数据类型：10X Genomics标准单细胞数据（自测下机数据、GEO/SRA下载公共数据...

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《Horticulturae》文章“Exploring the Genomic Landscape: A Comprehensive Analysis of the Gene...

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单细胞水平解析m6A修饰一直存在数据分散、方法差异大的问题，实际使用中往往需要研究者自行整合数据、编写代码分析，门槛较高。在此基础上，最新研究在完成多种单细胞m6A识别方法系...

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生物信息学数据库大全：28个常用生信数据库汇总（单细胞、转录组、蛋白质、通路分析必备） 随着高通量测序技术的发展，生物信息学数据库已经成为生命科学研究不可或缺的基础设施。无论...

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随着高通量组学数据的爆炸式增长，目前针对同一物种的各类组学数据（如基因组、表观组、转录组、蛋白质组、代谢组等）散布于众多平台和文献之中。由于缺少统一的存储标准和整合机制，科研...

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GEO数据库构成： 1. GEO Platform (GPL)芯片平台 定义：描述实验使用的芯片或测序技术平台。 内容：包含探针与基因的对应关系、平台设计参数等元数据。 示例...

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GSEA富集分析的基本原理是使用预定义的基因集 （例如：铁死亡通路，只要能获取到相关基因，就能定义成一个基因集），将基因按照在两类样本中的差异表达程度进行排序，然后检验这些预...

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价值：高通量测序分析后的分子列表往往过于庞大，仅依赖P值或Fold Change等传统方法进行筛选。TRIAGE R软件包（表观遗传学指导的转录调控推断分析）提供一套科学、多...

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1. 富集分析基础知识 1.1 什么是富集分析？为什么要做富集分析？ 富集分析（Enrichment Analysis）是生物信息学中一种重要的分析方法，主要用于识别在特定生...

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进行单细胞测序数据分析,Harmony是目前最常用的去批次工具之一，但在RStudio（特别是网页版/Server版）环境中配合Seurat使用时，经常会遇到关于对象命名的报...

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进行单细胞转录组分析，有时候用到公共数据集，尤其是从GEO下载的10X数据，很多研究者常常会遇到一个令人头疼的问题——数据明明能读入，却无法正常创建Seurat对象。本文通过...