由于太久没有分析过bulk数据了，前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚，所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白，也刚刚了解NG...
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芯片数据和RNA-seq的差异分析流程 -
分享个单细胞配受体互作强度的计算方法
前言 这一块涉及到细胞通讯的内容，那么目前定义细胞通讯利用的是细胞配体，受体蛋白互作来定义的，这里盗取一张示意图（图片来自百度） 联想到单细胞数据来看，单细胞转录组数据衡量的...
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2021-03-15 DepMap数据库偶然发现了这个神奇的网站（https://depmap.org/portal/），对于实验狗的我而言，想想以前走的各种弯路，顿感相见恨晚啊！废话少叙，直接来看看这个DepM...
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有相关性就有因果关系吗，教你玩转孟德尔随机化分析（mendelian randomization ）
流行病学研究常见的分析就是相关性分析了。 相关性分析某种程度上可以为我们提供一些研究思路，比如缺乏元素A与某种癌症相关，那么我们可以通过补充元素A来减少患癌率。这个结论的大前...
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利用10X单细胞eQTL定位确定自身免疫性疾病的细胞类型特异性基因控制周二了，新的一周，虽然内心一直想躺平，一直想回家，但是最终还是屈服，坐起来好好工作，不知道30岁一事无成算不算就是失败的人生，人是不是总是在矛盾中前进，也不知道前面有什么，或...
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10X单细胞（10X空间转录组）聚类算法之leidenhello，大家好，今天我们来分享一下最新常用的聚类算法----leiden，其实大家在看Seurat的函数FindClusters可能会观察到，其中有一个参数algorit...
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R Package Scissor 学习笔记简介Scissor R包提出的Scissor算法(function Scissor)，这是一种新颖的单细胞数据分析方法。利用批量（bulk）表型从单细胞测序(scRNA-se...
