老师虽然只让构建ML和贝叶斯进化树,没有要进一步美化进化树,自己先学着,为以后使用留个底。我使用的软件是figtree v1.4.4,具体使用步骤如下:第一步,导入树文件,可...

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自己在研究生的第一个项目就是处理重测序数据,在做的过程中参考了很多资料,现在把整个重测序的上游分析流程分享给大家,一些关键环节已经帮大家踩过坑了,相信跟着学习实践一定能够收获...
circos可以说是基因组文章必备的主图了。现在也有好多教程,先分别探讨下个人喜好点。 circos的软件。看官网的图,是不是非常酷炫。但是真正用好,研究明白会很痛苦。因为他...
前言 最近进行基因组数据分析,绘制圈图,想做两个基因组的比较分析,通过查询文献,发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好,主要就是染色体排布中间对称,这样共线性连线就不会出现交叉...
R语言绘图包系列: R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...
前言 在发表文章之前我们需要将测序的原始数据上传到一个公共库,并在文中提供accession number,实现数据的公开共享,这是国际惯例。以前我们上传数据时只能上传到美国...
叶绿体/线粒体在线注释网站GeSeq 上篇介绍了一个线粒体在线注释网站,MITOS,今天呢白鱼小编继续给大家推荐另一个在线注释网站,GeSeq。该网站即可用于注释线粒体,也可...
今天介绍基础概念 该流程图简要概述了加权基因共表达网络分析的主要步骤。图片来源于:https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/ar...
plink是由哈佛大学开发的一个免费、开源的全基因组关联分析软件,功能非常强大。基础的文件格式转换、质量控制,到需要大量运算的群体分层分析、连锁不平衡计算、单体型构建等,都可...