下载数据 TCGA官网下载TCGA-COAD projiect的HTSeq-counts 和clinical的manifest文件。然后在电脑终端用gdc-client下载数...
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WGCNA（3）：基因模块与性状关联识别重要基因前面的文章中完成了数据导入和网络构建，下面是将基因模块与性状进行关联，从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
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RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤，最终获得基因表达信息。...
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CRISPR-Cas9（三）--sgRNA设计好之后简单整理一下：protocol-使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑（一）https://www.jianshu.com/p/bfb34ba1050dprotocol-...
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CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA设计大佬说，我只说一次，你自己要记住以最火热的p53为例 Step 1 先找p53基因序列 1. NCBI--输入p53并选择物种human：tumor protein p53 ...
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「文献」多倍体植物基因组测序组装当前策略
「文献」多倍体植物基因组测序组装当前策略 文献地址: Current Strategies of Polyploid Plant Genome Sequence Assemb...
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如何快速查找物种间对应的同源基因有时候，大家做实验以小鼠为模型，但希望查看与之对应的人同源基因。像这种情况，我们可以不需要进行序列比对来查找，因为比较麻烦。使用公共数据可能更高效。 1.基于NCBI Hom...
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Ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看如今大量物种参考基因组数据已被公布，对于科研工作者，可以说是一笔巨大“财富”。那么该如何获取这笔“财富”呢？ 本期将介绍几个相关的数据库，并举例演示如何查找和下载到想要的参考...
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Counts FPKM RPKM TPM CPM 的转化
一、什么是RPKM、 FPKM、TPM、CPM RPKM, FPKM and TPM, clearly explained - StatQuest!!
