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【r<-生信|芯片分析】Bioconductor分析基因芯片数据我2017年用的域名失效了，我之前那个网站也没用了，所以这篇文章之前提供的链接跳转不过去。我现在直接在简书提供全文，然后新的链接是：https://www.shixiangw...
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Affymetrix 芯片数据处理流程及原理简介版权所有，转载必究！ 本文作者:任红雷, 联系邮箱: renhongleiz@126.com 本文整理自个人汇报的PPT 首先，本文将结合代码讲解常用的Affymetrix ...
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【r<-ggplot2】cowplot介绍原作者： Claus O. Wilke翻译：王诗翔 2018-07-15 cowplot是ggplot2包的一个简单插件，它的目的是为ggplot2提供一个出版级别的主题，使...
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单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：可视化套件单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类 单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：PAGA轨迹推断 单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：使用ing...
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单细胞测序（scRNA-seq）通关||数据处理必知必会单细胞转录组数据分析系列教程 sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类scanpy 是一个用于分析单细胞转录组（single cell rna sequencing)数据的python库，文章2018发表在Genome Biology。其实它的...
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【exec】shell脚本中的 exec 命令exec 是 bash 的内置命令 shell 的内件命令exec执行命令时，不启用新的shell进程。 source 和 .不启用新的shell，在当前shell中执行，设...
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Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件之前分析过的测序数据，数据质量都很好，给了我一个错觉质控的前后差别不是很大，内心里对质控这一步也就不是很重视，跑完质控有时也懒得看结果，拿到一批测序数据后，也总是忽略了去看测...
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第10篇：ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
由于基因表达调控机制的复杂性，多种组学数据的整合分析，从不同的层面探究生物问题越来越重要。从RNA-Seq层面，我们可以探究哪些基因具有显著差异，上调或下调；从ChIP-Se...
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第9篇：差异peaks分析——DiffBind学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...
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第3篇：用MACS2软件call peaks学习目标： 学会用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的结果 Peak Calling Peak calling即利用计算的方法找出ChIP...
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生物基础知识-CDS、ORF、启动子、终止子、转录因子、UTR刘小泽写于2020.2.8大概回顾一下基础知识 一：ORF与CDS ORF：open reading frame（开放阅读框） 它是理论上的蛋白编码区，一般是先在DNA序列中...
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第1篇：ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同ATAC-Seq简介 ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput seq...
