单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 我们也来到了空间蛋白组的课程范围了。 为什么做了空间转录组，还要做空间蛋白组，也就是说转录组和蛋白组的对应关系如何，这个多次在课程上谈到了。 C...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 今天我们分享文献，看看细胞邻域分析重要的生物学意义（CODEX）。 参考文献 知识积累 抗肿瘤免疫需要免疫肿瘤微环境（iTME）组分之间有组织的...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 生物信息，生物在前，技术为生物认知服务，所谓生信人员，要经常看文献，总结经验，学以致用，光会分析没有用，要和课题，生物研究相结合才行。 今日参考...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 单细胞空间外显子课程这周第四课就结束了，感兴趣的可以联系。 今日参考文献 从多样本空间转录组学(ST)数据中检测和解剖异常组织结构域(DDATD...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 之前分享了很多关于多组学的内容了，其中涉及到外显子的部分分析呢，我基本都一笔带过了，很多高分文章都运用到了外显子突变类的信息分析，以下为文章示例...

cc的生信随记

SigProfiler 提供一套全面、集成的生物信息学工具，用于执行突变特征分析。该软件涵盖了从生成突变矩阵到特征提取的整个分析生命周期，以及绘图和模拟支持功能。 1. Si...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 科研和临床其实有很多共同的地方，大家都知道多组学是方向，目前单细胞转录组、ATAC、VDJ、空间转录组、空转VDJ、宏基因组、外显子等几个方向...

11的雾

前提：众所周知，GATK 为人提供了 一些 boundle resource ，但是没有提供小鼠的资源。比如dbsnp， indel，这些都是需要自己准备的。而在跑BaseR...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 参考文章Effect of the intratumoral microbiota onspatial and cellular heterog...