系列回顾:ArchR官网教程学习笔记1:Getting Started with ArchR[https://www.jianshu.com/p/a2bcdfb77961]A...

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贴一张图博您一笑(小小镇楼) 前言 相比于四四方方的相关性图来说,有时候三角形图会让人眼睛一亮;当你见惯了方形图之后,偶见一此类图,会不会有新意、新鲜感。 1. 简单介绍一下...
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关于查找motif,目前有很多种软件可以进行预测。我所在的实验室通常使用FIMO(MEME套件里的一个),但是有很多文献里也提到了HOMER这个软件,并且不乏一些影响因子很高...
写在前面 可能第一眼看到这个标题大家都会很奇怪,因为2G内存的服务器还要分析上游的话,不太可能,确实在中间我把比对的过程跳过了服务器生信分析平台配置参考https://zhu...
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
我们用seurat选取HVG来进行细胞轨迹推断,并且过滤了一些低质量的细胞 加载相应的工具包 本文的数据和预处理来源于:单细胞之轨迹分析-2:monocle2 原理解读+实操...
网页参考(首推):http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/Gviz/inst/doc/Gviz...