KS科研分享与服务

CellPhoneDB作为出镜率很高的细胞互作分析工具，也是大家公认的。网上有很多教程，按理说在自己单细胞系列也应该出一个教程，但是由于CellPhoneDB是基于pytho...

Seurat_Satija

导读 在肿瘤相关研究中，一张精美的生存分析图，已经成了肿瘤研究高分文章的标配。好的临床预后效果，往往在一定程度上决定了文章发表的层次。然而对刚刚拿到一个新基因的新手来说，生存...

王诗翔

之前分析TCGA数据都是直接匹配barcode，其规则懂的不多。相信有不少同志也有这方面困惑。 这里给出两份资料，一份是TCGA官方英文介绍，链接为https://wiki....

单细胞空间交响乐

隔离的第四天，一个人的日子总是很难熬，孤独的生活却总是来到我的身边，这一篇我们来分享EcoTyper的示例代码，帮助我们来寻找细胞特异性转录状态和共关联模式。这篇发表于cel...

单细胞空间交响乐

隔离的第三天，一个人的日子总是很难熬，没办法，孤独总是常伴我身，今天我们分享的文献在Atlas of clinically distinct cell states and ...

六六_ryx

学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...