240 发简信
luly
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    系统 发育树

    定义 系统发育进化树 (Phylogenetic tree)： 一般也叫系统进化树，进化树。它可以利用树状分支图形来表示各物种或基因间的亲缘关系...

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  • 有参转录组的比对

    一、数据准备 1、测序数据 （1 ）公司获得（2） NCBI下载/ENA下载 2、参考序列准备 （1）基因组序列 下载地址：Ensembl、En...

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    PGDspider的使用

    1、该软件的使用需要在java环境内，下载java并安装 https://download.oracle.com/java/18/latest/...

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    下载vcftools、linux与Filezilla链接、关于Linux的IP

    1 下载vcftools 提示：gzip: stdin: not in gzip formattar: Child returned statu...

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  • PCA图

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    Fst、PI、TajimaD值的计算

    Fst值的计算 群体间分化指数fst,取值范围0~1，值越大表明群体间分化程度越高，亲缘关系越远。 这个窗口大小和步长不影响结果 曼哈顿图 首先...

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  • Admixture 进行遗传结构分析

    VCF格式转换 利用vcftools将群体SNP的vcf文件转换成plink可以分析的格式 SNP过滤 Admixture计算 提取CV err...

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    LD衰减图

    LD衰减距离指的是，当平均LD系数衰减到一定大小(最大值的一半/0.5以下）的时候，对应的物理距离。通常用LD衰减距离来描述LD衰减速度。LD衰...

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  • VirtualBox虚拟机与主机不能复制，粘贴的问题

    1 虚拟机设置—》常规—》高级—》共享粘贴板，选择双向—》拖放，选择双向 2 虚拟机设置—》存储—》控制器IDE属性—》勾选使用主机输入。。。。...

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