GWAS流程 材料选择 1.材料选择的基本原则 遗传变异和表型变异丰富; 群体结构分化不能过于明显,发生生殖隔离是不能做GWAS的,如亚种以上(亚种需单独进行GWAS,粳稻和...
    
  GWAS流程 材料选择 1.材料选择的基本原则 遗传变异和表型变异丰富; 群体结构分化不能过于明显,发生生殖隔离是不能做GWAS的,如亚种以上(亚种需单独进行GWAS,粳稻和...
    
  全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study, GWAS)是以连锁不平衡(LD)为基础,利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记,鉴定与复杂性...
    
  通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...
    
  前面的文章中完成了数据导入和网络构建,下面是将基因模块与性状进行关联,从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA(1):R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
    
  本节概览1. WGCNA基本概念:定义、关键术语、基本流程、一些注意事项2. WGCNA运行:⓪输入数据准备①判断数据质量,绘制样品的系统聚类树②挑选最佳阈值power③ 构...
什么是Ka/Ks The ratio of the number of nonsynonymous substitutions per nonsynonymous site ...
    
  本文参考https://docs.qq.com/doc/DZEFHalVWU3lQcVFR?from=singlemessage,仅供自学和分享,如有侵权立删 此图为一篇文献...
    
  写在前面 很久很久以前,各种原因,我写过一个帖子,《零基础-完全重现某个基因家族分析文章(的分析部分)》 https://www.jianshu.com/p/88075f6c...
    
  基因组的序列提取,详情请看我之前的教程:https://www.jianshu.com/p/211a262aebc4 基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast...