首先非常感谢Cj大神开发出来的TBtools生信工具,为生信分析做图带来了极大的便利。作为生信小白,在做多物种间共线性分析时,尝试了多种方法,苦于没有计算机基础,一直没能完成...
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写在前面 最近了解了一些与蛋白质分析相关的文稿,有TBtools老铁用户提供了不少参考资料和分析建议。早晨,他突然提起了,一些蛋白质理化性质分析相关指标的计算,鼓捣起来还是麻...
GWAS流程 材料选择 1.材料选择的基本原则 遗传变异和表型变异丰富; 群体结构分化不能过于明显,发生生殖隔离是不能做GWAS的,如亚种以上(亚种需单独进行GWAS,粳稻和...
全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study, GWAS)是以连锁不平衡(LD)为基础,利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记,鉴定与复杂性...
通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...
前面的文章中完成了数据导入和网络构建,下面是将基因模块与性状进行关联,从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA(1):R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
本节概览1. WGCNA基本概念:定义、关键术语、基本流程、一些注意事项2. WGCNA运行:⓪输入数据准备①判断数据质量,绘制样品的系统聚类树②挑选最佳阈值power③ 构...
什么是Ka/Ks The ratio of the number of nonsynonymous substitutions per nonsynonymous site ...
本文参考https://docs.qq.com/doc/DZEFHalVWU3lQcVFR?from=singlemessage,仅供自学和分享,如有侵权立删 此图为一篇文献...