适用于多个样本合并分群之后想要再次修改样本名称
发简信
IP属地：湖北
-
@落英神剑_bd12 我用软件自带数据没有遇到这样的情况，所以不太清楚
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering
SCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
-
@校童 括号后面是转录因子作用的靶基因
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering
SCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
-
@小丑先生_0514没有哦，不过画这个图只需要两列信息，一列基因，一列logFC
画一个有标签的火山图—标出显著变化的基因
参考：ggplot2绘制火山图实例 还可以添加title 用点的面积表示abs(logFC)的大小
-
-
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and ClusteringSCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
-
@我是刘小逗 一般用的是Seurat对象
Monocle拟时间分析
Monocle可以进行下面三种类型的分析，可以与seurat无缝连接： 1 对细胞进行聚类、分组和计算；2.进行拟时间分析；3.差异表达分析； 2.Constructing ...
-
Monocle拟时间分析Monocle可以进行下面三种类型的分析，可以与seurat无缝连接： 1 对细胞进行聚类、分组和计算；2.进行拟时间分析；3.差异表达分析； 2.Constructing ...
-
PCA主成分分析实战和可视化 | 附R代码和测试数据一文看懂PCA主成分分析中介绍了PCA分析的原理和分析的意义(基本简介如下，更多见博客)，今天就用数据来实际操练一下。 在生信宝典公众号后台回复“PCA实战”，获取测试数据。...
-
【ComplexHeatmap包学习笔记】2.5 Seriation从学习用OncoPrint画基因组突变的“瀑布图”，发现顾博士创造的ComplexHeatmap是非常强大的一个包。 顾博士在他的GitHub上展示了这个强大的包在分析基因组...
-
不好意思，genes.use那一步我漏掉了，已经修改过来了。谢谢提醒~
Seurat：Integrating stimulated vs. control PBMC datasets to learn cell-type specific responses
说明：仅根据官网指南加个人理解，目前官网上发布了3.0版本的指南，下面内容是2.4版本，内容上有些许出入。 整合分析的目的： 1. 鉴定在两种数据集中都存在的细胞类型2. 得...
