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    “单细胞空间转录组”数据分析真的实现“单细胞”了吗?

    如果你关注过近两年的生命科学进展,一定听过“空间转录组”这个热词。这项技术被誉为继单细胞测序之后的又一革命性突破,被《Nature Method...

  • 将.h5ad转换成Seurat可识别格式

    很多时候从数据库下载的处理过的各种单细胞数据格式都是.h5ad或者.h5。本篇内容就先给一个处理.h5ad文件的脚本。 读取文件,并查看文件包括...

  • Stero_seq单细胞处理工具cellbin2使用

    很久没有这么大体量的搞过数据了。最近在整理cellbin,真的整的我心累。 一般情况下是直接创建conda 环境,然后写一大堆模型和函数,你在这...

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  • 安装一个jupyter所有环境可以共用

    在base环境下安装 jupyter lab或者 notebook在创建的不同环境中使用ipykernel就可以了。 下面是一个例子:1、在ba...

  • steropy安装使用

    安装 安装jupyter lab 即可然后详细学习官网上的流程即可。

  • 在不同环境下使用trackpy

    直接打开 moniconda 使用 conda install 安装了trackpy package。 那么我就是安装在了base环境下面。...

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  • pySCENIC安装的BUG&deBUG过程

    嗯,很有必要整理一下这个软件遇到的很多问题。作为分析regulon的一个工具,SCENIC有两张版本,一个是R版本,一个是python版本。R版...

  • pySCENIC安装问题

    在Linux安装 pySCENIC,conda安装之后,显示安装成功了。但是pyscenic -h 的时候出错了。errors out afte...

  • 我的生娃记录

    最近生孩子了,所以休息了一段时间,最近感触很多,就想日常记录一下吧。小宝宝并不是意外,是我期待了很久的结果。怀孕期间心情一直很愉悦,也不存孕吐、...