统计分析与可视化是R语言最强的两个点。本节简要介绍一些R基础绘图中的参数。R图形可设置的参数很多，大概可以分为以下几大部分： 图像的保存。不同类型的保存大致步骤相同，如保存为...
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R语言各个图形参数设置及其意义 -
stringr处理字符串与正则表达式
一、安装加载R包 二、 字符串基础 2.1 字符串长度 str_length() e.g. 2.2 字符串组合 str_c(..., sep = "", collapse =...
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R中如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol
方法一 在R中如何利用ENSEMBL ID获得Gene ID(ENTREZID), 又或者转换为Gene Symbol，以人为例： 预先安装AnnotationDbi 和 o...
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收藏贴之一 | 写过热图工具的人，给你理清热图数据标准化写在前面 热图，或称热力图，是外文 Heatmap 的直译。在几乎所有数值分析相关工作中都可以看到。生物信息学数据，自然躲不过。无论是形态数据，还是基因拷贝数数据，或是基因表...
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estimate 包所有函数超详细解读及计算免疫浸润评分estimate包可以通过RNA-seq的数据来计算标本的免疫及机制评分，进而评估肿瘤的纯度，其原理通过特征的肿瘤的RNA-seq的signture来评估以上内容，其输入文件...
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R语言Cibersort文件获取+代码在R语言中运行Cibersort共需要三个文件，分别是（1）官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表达矩阵；（3）Cibersort代码。 （1）LM2...
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TCGA数据整合后进行DESeq2差异表达分析和基于R的多种可视化测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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R语言基础入门(6) slice根据索引按行操作数据
本节来介绍dplyr中的行选择函数slice，此函数可轻松的按照索引对行进行处理 取前3行 取第三行至最后一行 取第5行至最后一行 取最后一行 取前5行 取最后5行 将第一行...
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R语言分组统计之aggregate()基础函数与reshape包
分组统计是指对一组或若干组观测值(例如各科成绩)，基于分组水平（例如每个班级），统计出每个班级的数据分布特征（均值、总和...）。目前所了解的有三种方式，一是基础包stats...
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R-tidyverse系列-dplyr表格操作
stringr字符处理 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/2e5063407d83]dplyr表格操作 - 简书 (j...
